More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4488 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  47.89 
 
 		 751 aa  712    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 835 aa  1719    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  44.25 
 
 		 801 aa  711    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  45.9 
 
 		 797 aa  676    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  41.04 
 
 		 821 aa  582  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  41.21 
 
 		 706 aa  545  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  43.81 
 
 		 744 aa  528  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  35.93 
 
 		 758 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  35.69 
 
 		 758 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  35.57 
 
 		 758 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  35.63 
 
 		 758 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  34.69 
 
 		 758 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 689 aa  385  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 694 aa  357  5e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 682 aa  357  5e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 693 aa  340  9e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  32.01 
 
 		 689 aa  339  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 719 aa  339  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 727 aa  338  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 730 aa  335  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 695 aa  334  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 734 aa  332  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  32.35 
 
 		 687 aa  324  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  32.35 
 
 		 687 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  29.96 
 
 		 778 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 680 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 681 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 685 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 682 aa  303  9e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 694 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 705 aa  299  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 751 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 681 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 698 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 681 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 698 aa  298  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 751 aa  298  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 692 aa  298  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 725 aa  297  6e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 698 aa  297  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 693 aa  296  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 742 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 677 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 677 aa  294  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 724 aa  293  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 681 aa  292  2e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  31.21 
 
 		 681 aa  289  2e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.32 
 
 		 600 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  30.22 
 
 		 685 aa  286  8e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 709 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 709 aa  285  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 702 aa  281  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 699 aa  279  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  27.78 
 
 		 709 aa  279  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  29.29 
 
 		 744 aa  276  9e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 713 aa  273  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 695 aa  263  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 702 aa  259  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 727 aa  259  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 685 aa  259  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 708 aa  244  5e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  28.46 
 
 		 782 aa  233  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 707 aa  232  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 676 aa  231  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 799 aa  229  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 733 aa  229  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 714 aa  229  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 783 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 705 aa  224  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 784 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 		 719 aa  219  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 719 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 714 aa  217  8e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 789 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  27.7 
 
 		 774 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 784 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 723 aa  211  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 731 aa  210  7e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  23.29 
 
 		 868 aa  209  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 702 aa  187  9e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 766 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 836 aa  146  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 763 aa  143  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 735 aa  141  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  37.1 
 
 		 249 aa  125  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 776 aa  110  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2339  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 797 aa  107  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.608898  normal  0.596694 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  31.05 
 
 		 776 aa  88.6  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 818 aa  88.2  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 759 aa  88.2  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 776 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 698 aa  82.8  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 801 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  25.12 
 
 		 748 aa  78.2  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  25.11 
 
 		 750 aa  76.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  24.26 
 
 		 776 aa  71.6  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 760 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  30.3 
 
 		 803 aa  68.6  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  33.33 
 
 		 688 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  40.68 
 
 		 681 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>