More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01505 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1588  TonB-dependent receptor  54.13 
 
 		 716 aa  747    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  100 
 
 		 803 aa  1619    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  41.19 
 
 		 833 aa  600  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  43.65 
 
 		 791 aa  602  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1311  TonB-dependent receptor  45.71 
 
 		 720 aa  595  1e-169  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  41.17 
 
 		 793 aa  593  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  40.78 
 
 		 815 aa  567  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1899  TonB-dependent receptor, putative  37.11 
 
 		 794 aa  462  1e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5745  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 691 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000026559  normal  0.448154 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 958 aa  121  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  29 
 
 		 942 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  21.31 
 
 		 854 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  29.51 
 
 		 914 aa  113  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  27.27 
 
 		 788 aa  93.6  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1414  hypothetical protein  27.21 
 
 		 871 aa  90.1  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.530363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  24.73 
 
 		 791 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 793 aa  81.6  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 791 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 816 aa  79.7  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  23.13 
 
 		 795 aa  79  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 705 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  25.56 
 
 		 872 aa  77  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  43.24 
 
 		 1010 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 874 aa  77  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1004 aa  75.9  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  24.76 
 
 		 848 aa  74.7  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  27.82 
 
 		 833 aa  73.9  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  34.02 
 
 		 1027 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1076 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 753 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1043 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  30.34 
 
 		 1076 aa  72.4  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 		 807 aa  72.8  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 982 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  25.09 
 
 		 808 aa  72.8  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  24.76 
 
 		 780 aa  72.4  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 790 aa  72.4  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 		 1102 aa  72  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 814 aa  72  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 1161 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 1050 aa  72  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 		 806 aa  72  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 828 aa  71.6  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 1127 aa  71.6  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 1062 aa  71.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 1101 aa  71.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  23.02 
 
 		 824 aa  71.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 		 810 aa  71.2  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1051 aa  71.2  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 791 aa  71.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 787 aa  70.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  34.35 
 
 		 1056 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  28.01 
 
 		 800 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1095 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4139  TonB-dependent receptor plug  42.45 
 
 		 1139 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.380719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 769 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1079 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 1148 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  26.73 
 
 		 1063 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  24.73 
 
 		 786 aa  69.3  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1105 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 1020 aa  68.9  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 1050 aa  69.3  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 789 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 835 aa  68.6  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 996 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 		 1117 aa  67.4  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1006 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 1043 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 777 aa  67.4  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 975 aa  67.4  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1040 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  25.38 
 
 		 799 aa  66.6  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 988 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1085 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1012 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1181 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 794 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 1013 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 780 aa  65.1  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1107 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 1037 aa  65.1  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 1010 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 705 aa  65.1  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 798 aa  65.1  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 814 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  34.68 
 
 		 1025 aa  63.9  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  37.72 
 
 		 795 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 		 1034 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 828 aa  63.9  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1059 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  21.56 
 
 		 723 aa  63.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 747 aa  63.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  27.2 
 
 		 1080 aa  63.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 1008 aa  62.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  35.2 
 
 		 1070 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  26.21 
 
 		 758 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 736 aa  63.5  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  28.03 
 
 		 816 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  21.54 
 
 		 805 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>