288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1414 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1414  hypothetical protein  100 
 
 		 871 aa  1793    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.530363 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  37.76 
 
 		 854 aa  556  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  36.09 
 
 		 914 aa  488  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  33.95 
 
 		 942 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 		 958 aa  430  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02635  hypothetical protein  25.16 
 
 		 954 aa  150  7e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0363772  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1168  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 939 aa  147  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0578  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 		 903 aa  122  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 815 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 833 aa  104  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 793 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  26.38 
 
 		 803 aa  92.4  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 791 aa  91.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1311  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 720 aa  91.3  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1899  TonB-dependent receptor, putative  23.58 
 
 		 794 aa  88.6  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1588  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 716 aa  84.3  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 836 aa  82.4  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 828 aa  70.1  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 874 aa  67.8  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 1050 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 887 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  25.96 
 
 		 812 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 845 aa  65.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 987 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 999 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 828 aa  63.5  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 763 aa  63.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 815 aa  62.4  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 779 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 1062 aa  62.4  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  26.19 
 
 		 677 aa  62  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5745  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 691 aa  62  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000026559  normal  0.448154 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 1004 aa  60.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  34.03 
 
 		 1071 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 1062 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  25.39 
 
 		 878 aa  60.1  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 1105 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1071 aa  60.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 1073 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1008 aa  58.9  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  27.14 
 
 		 1020 aa  58.9  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 1089 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 854 aa  58.5  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 1049 aa  58.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1574  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1155 aa  57.8  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923861  normal  0.0467053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 982 aa  57.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  26.4 
 
 		 618 aa  57.8  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0185  ragA protein  29.86 
 
 		 1017 aa  57.4  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.458513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  23.12 
 
 		 996 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 1124 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  26.83 
 
 		 807 aa  56.6  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 994 aa  57  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 1033 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 780 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1139 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1008 aa  56.2  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 986 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3676  TonB-dependent receptor, plug  30.05 
 
 		 735 aa  55.8  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4126  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 1134 aa  55.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 972 aa  55.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  26 
 
 		 809 aa  55.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  27.46 
 
 		 746 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1188 aa  55.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  39.78 
 
 		 1023 aa  55.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  33.6 
 
 		 946 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 		 1028 aa  55.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 769 aa  55.1  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1076 aa  54.7  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0604  TonB-dependent outer membrane receptor  26.94 
 
 		 682 aa  54.7  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 602 aa  54.7  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  28.3 
 
 		 746 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 757 aa  54.7  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 759 aa  54.3  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  23.24 
 
 		 1021 aa  54.3  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5346  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 763 aa  54.3  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  35.34 
 
 		 1052 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 		 1076 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 971 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1101 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 818 aa  54.3  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 1084 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 1034 aa  53.5  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  27.8 
 
 		 833 aa  53.1  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 882 aa  53.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  32.86 
 
 		 1192 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  40.21 
 
 		 1144 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 929 aa  53.5  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 866 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  26.27 
 
 		 795 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1116 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  35.09 
 
 		 924 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 957 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  25.19 
 
 		 919 aa  53.5  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 1014 aa  53.5  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1075 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1064 aa  53.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  24.17 
 
 		 1102 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1023 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 1063 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 		 1093 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>