153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1311 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1311  TonB-dependent receptor  100 
 
 
720 aa  1485    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1588  TonB-dependent receptor  49.43 
 
 
716 aa  664    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  45.71 
 
 
803 aa  615  1e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  38.61 
 
 
833 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  40.39 
 
 
791 aa  489  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  38.92 
 
 
793 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  37.03 
 
 
815 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1899  TonB-dependent receptor, putative  36.27 
 
 
794 aa  421  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5745  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 
691 aa  201  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000026559  normal  0.448154 
 
 
-
 
NC_002950  PG1414  hypothetical protein  31.3 
 
 
871 aa  102  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.530363 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 
854 aa  100  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  28.71 
 
 
914 aa  90.9  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  27.88 
 
 
942 aa  90.5  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 
958 aa  85.1  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  22.21 
 
 
700 aa  63.9  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  22.21 
 
 
700 aa  63.9  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 
700 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 
700 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 
700 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 
640 aa  62.4  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 
700 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 
700 aa  62  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  22.38 
 
 
739 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 
700 aa  62  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 
627 aa  61.6  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  22.19 
 
 
706 aa  61.6  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 
614 aa  61.2  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  22.06 
 
 
706 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  22.06 
 
 
706 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 
634 aa  60.1  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  30.49 
 
 
646 aa  60.1  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  21.97 
 
 
728 aa  60.1  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  30.48 
 
 
623 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 
700 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  22.01 
 
 
721 aa  58.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.58 
 
 
1023 aa  58.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  20.5 
 
 
705 aa  58.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  22.99 
 
 
614 aa  57.8  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  22.04 
 
 
706 aa  57.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  22.24 
 
 
708 aa  57  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 
736 aa  57  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 
705 aa  57  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 
688 aa  55.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 
703 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 
742 aa  53.5  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 
619 aa  53.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  21.06 
 
 
712 aa  52.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 
624 aa  52.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 
614 aa  52.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  26.39 
 
 
613 aa  52.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  22.15 
 
 
746 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 
762 aa  52  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  21.07 
 
 
715 aa  52  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.7 
 
 
653 aa  51.2  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  21.98 
 
 
718 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2608  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 
824 aa  50.8  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 
828 aa  50.8  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 
602 aa  50.8  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  22.89 
 
 
768 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 
659 aa  50.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  22.09 
 
 
711 aa  50.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.12 
 
 
766 aa  50.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 
828 aa  50.4  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.62 
 
 
631 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 
730 aa  49.7  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 
828 aa  50.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  23.4 
 
 
713 aa  49.7  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2998  TonB-dependent receptor  22.09 
 
 
799 aa  49.7  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 
634 aa  50.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 
625 aa  48.9  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  20.93 
 
 
757 aa  48.9  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0676  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 
732 aa  49.3  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.218893  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.73 
 
 
614 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 
803 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  21.56 
 
 
708 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.73 
 
 
614 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 
790 aa  48.5  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  26.9 
 
 
706 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.73 
 
 
614 aa  48.9  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.73 
 
 
614 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 
835 aa  48.5  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  26.9 
 
 
710 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  22.1 
 
 
728 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  20.72 
 
 
780 aa  48.5  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 
641 aa  48.5  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 
836 aa  48.1  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0363  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 
649 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  25 
 
 
746 aa  48.1  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.55 
 
 
619 aa  48.1  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 
706 aa  47.8  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 
768 aa  47.8  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  21.33 
 
 
720 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  21.58 
 
 
681 aa  47.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  24.35 
 
 
701 aa  47.8  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  24.39 
 
 
757 aa  47.8  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 
670 aa  47.8  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  21.98 
 
 
617 aa  47.4  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  25 
 
 
638 aa  47.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  21.61 
 
 
695 aa  47  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 
611 aa  47.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.362217 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>