More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1487 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  46.17 
 
 		 942 aa  816    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  43.63 
 
 		 914 aa  777    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 958 aa  1963    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  35.92 
 
 		 854 aa  525  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1414  hypothetical protein  32.42 
 
 		 871 aa  416  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.530363 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02635  hypothetical protein  24.16 
 
 		 954 aa  166  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0363772  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1168  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 939 aa  149  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0578  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 903 aa  134  7.999999999999999e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  27.13 
 
 		 803 aa  121  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 815 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 793 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 833 aa  107  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 791 aa  102  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  35.75 
 
 		 1068 aa  99.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 1105 aa  96.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 972 aa  94  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_002950  PG1899  TonB-dependent receptor, putative  28.63 
 
 		 794 aa  90.5  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 874 aa  89.4  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 		 1051 aa  88.6  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1003 aa  88.2  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  32.14 
 
 		 1080 aa  87.8  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 991 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1588  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 716 aa  85.9  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1040 aa  84.7  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 1001 aa  84.7  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 882 aa  84.3  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  35.39 
 
 		 1004 aa  84  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 922 aa  83.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  34.08 
 
 		 1051 aa  83.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 1047 aa  83.2  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1053 aa  82.4  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 		 924 aa  82.8  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  37.65 
 
 		 996 aa  82.8  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 		 1095 aa  82.4  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 866 aa  82.4  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  30.34 
 
 		 1173 aa  82  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1064 aa  82.4  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  32.28 
 
 		 1026 aa  82  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  35.26 
 
 		 1046 aa  82  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1082 aa  81.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1057 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 1059 aa  80.9  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1101 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 		 1038 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  34.34 
 
 		 994 aa  80.9  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 1062 aa  80.9  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  39.5 
 
 		 1014 aa  80.5  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 957 aa  80.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  29.8 
 
 		 1095 aa  79.7  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  33.17 
 
 		 1043 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1063 aa  79  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 1004 aa  79  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 1053 aa  79  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 1117 aa  78.6  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 982 aa  79  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 931 aa  78.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1006 aa  77.8  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1096 aa  77.4  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 1049 aa  77.4  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  24.57 
 
 		 1142 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  35.03 
 
 		 1075 aa  77.8  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 1074 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 987 aa  77  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1094 aa  77  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 1085 aa  77  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  29.63 
 
 		 1018 aa  77  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  37.18 
 
 		 1031 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 1147 aa  77  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1034 aa  77  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 1030 aa  75.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1095 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 		 1079 aa  76.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 1033 aa  76.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 933 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 		 1107 aa  76.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 1189 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 		 1128 aa  76.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 975 aa  75.9  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  30.42 
 
 		 1188 aa  75.5  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 1034 aa  75.5  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  33.51 
 
 		 1038 aa  75.5  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 929 aa  75.1  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 962 aa  75.1  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 		 1028 aa  75.1  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 1008 aa  74.7  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 1144 aa  74.7  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 1114 aa  74.7  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1056 aa  74.7  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 996 aa  74.7  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 769 aa  74.7  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 933 aa  74.7  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1059 aa  74.7  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 989 aa  74.3  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1008 aa  73.9  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  35.48 
 
 		 1016 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 1034 aa  74.3  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  33.76 
 
 		 1076 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 1006 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  25.72 
 
 		 861 aa  74.3  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 1181 aa  74.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>