14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1168 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1168  TonB-dependent receptor  100 
 
 
939 aa  1916    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0578  TonB-dependent receptor  38.64 
 
 
903 aa  642    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02635  hypothetical protein  40.98 
 
 
954 aa  747    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0363772  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 
854 aa  206  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 
958 aa  145  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  24.31 
 
 
914 aa  141  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1414  hypothetical protein  22.49 
 
 
871 aa  137  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.530363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  23.35 
 
 
942 aa  134  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 
771 aa  48.9  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  21.84 
 
 
1003 aa  48.5  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 
793 aa  48.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
1063 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 
763 aa  45.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 
760 aa  45.8  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>