85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0578 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0578  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 903 aa  1857    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1168  TonB-dependent receptor  38.64 
 
 		 939 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02635  hypothetical protein  37.55 
 
 		 954 aa  637    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0363772  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 854 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  23.6 
 
 		 942 aa  156  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  22.84 
 
 		 914 aa  145  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 958 aa  135  5e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1414  hypothetical protein  21.72 
 
 		 871 aa  113  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.530363 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 1020 aa  60.8  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 		 998 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1034 aa  58.9  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 971 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 833 aa  58.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  26.07 
 
 		 803 aa  57.8  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  28.96 
 
 		 788 aa  56.6  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 		 1062 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1036 aa  54.7  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 760 aa  54.3  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  41.43 
 
 		 1102 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  33.61 
 
 		 787 aa  52.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 		 1052 aa  52  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1154 aa  52  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 		 1048 aa  51.6  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1028 aa  51.2  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1010 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 1006 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  23.78 
 
 		 799 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1038 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 793 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1040 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 1040 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  23.79 
 
 		 1071 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  27.14 
 
 		 1148 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  39.29 
 
 		 1013 aa  48.9  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  37.88 
 
 		 1116 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  35.06 
 
 		 1028 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  42.19 
 
 		 803 aa  48.9  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  36.71 
 
 		 1056 aa  48.5  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 1050 aa  48.5  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  33.72 
 
 		 791 aa  48.5  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  32.04 
 
 		 814 aa  47.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 806 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1023 aa  47.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  37.84 
 
 		 1045 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 757 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1051 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1259  TonB-dependent receptor plug  35.38 
 
 		 1106 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394544 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 814 aa  47.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  32.05 
 
 		 780 aa  47.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 996 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1040 aa  47  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 791 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 1040 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1060 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 1033 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  38.24 
 
 		 1095 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  39.34 
 
 		 1084 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 924 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1101 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 791 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 1059 aa  45.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1066 aa  45.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1068 aa  45.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1103 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 1026 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  29.76 
 
 		 833 aa  45.1  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 1114 aa  45.1  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 792 aa  45.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1127 aa  45.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  35.63 
 
 		 1109 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  41.38 
 
 		 1103 aa  45.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  35.37 
 
 		 997 aa  44.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 1119 aa  44.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 1038 aa  44.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 1144 aa  45.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 		 1142 aa  44.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1043 aa  45.1  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 815 aa  44.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  23.39 
 
 		 1107 aa  44.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 1023 aa  44.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  40.62 
 
 		 1173 aa  44.7  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  42.86 
 
 		 1142 aa  44.7  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1076 aa  44.3  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1145 aa  44.3  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1143 aa  44.3  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>