More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4749 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  59.71 
 
 		 804 aa  957    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 806 aa  1657    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  63.4 
 
 		 789 aa  1071    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  40.8 
 
 		 874 aa  594  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  38.78 
 
 		 775 aa  561  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  38.35 
 
 		 772 aa  549  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  36.72 
 
 		 875 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  37.67 
 
 		 881 aa  535  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  38.48 
 
 		 772 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  35.99 
 
 		 787 aa  512  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  37.82 
 
 		 814 aa  504  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  35.55 
 
 		 775 aa  500  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  35.84 
 
 		 792 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  35.04 
 
 		 800 aa  475  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  33.8 
 
 		 793 aa  468  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  34.39 
 
 		 790 aa  468  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  33.84 
 
 		 780 aa  465  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  32.09 
 
 		 791 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  34.57 
 
 		 923 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 923 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 852 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  32.04 
 
 		 872 aa  396  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  33.66 
 
 		 753 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  31.68 
 
 		 917 aa  368  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  31.06 
 
 		 928 aa  357  2.9999999999999997e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 803 aa  349  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 756 aa  338  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 791 aa  336  7.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 786 aa  316  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 800 aa  314  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 831 aa  278  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  27.47 
 
 		 888 aa  249  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  25.56 
 
 		 866 aa  171  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  24.57 
 
 		 906 aa  143  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  23.39 
 
 		 791 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 814 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  23.25 
 
 		 859 aa  108  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  23.9 
 
 		 860 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  30 
 
 		 802 aa  106  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  23.94 
 
 		 859 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  23.1 
 
 		 779 aa  101  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  22.49 
 
 		 865 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 897 aa  92.8  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  30.54 
 
 		 821 aa  91.3  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  29.17 
 
 		 767 aa  90.9  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 771 aa  88.6  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  21.89 
 
 		 777 aa  87.8  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  24.1 
 
 		 821 aa  87.8  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  30.08 
 
 		 827 aa  85.1  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 730 aa  84.3  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  33.79 
 
 		 1089 aa  84  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  25.96 
 
 		 822 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 800 aa  81.6  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 797 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 1060 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  33.91 
 
 		 1102 aa  77.4  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 701 aa  76.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  22.37 
 
 		 897 aa  76.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  20.17 
 
 		 902 aa  74.7  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 888 aa  72.4  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1064 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 1026 aa  72  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 1117 aa  71.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 1144 aa  71.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 933 aa  71.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 1062 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 792 aa  70.1  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 865 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 952 aa  70.1  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 874 aa  70.5  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 935 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1082 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 760 aa  69.3  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 966 aa  68.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1161 aa  68.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 1087 aa  67.8  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1047 aa  67.4  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 833 aa  67.4  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1234  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 716 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  34.35 
 
 		 1181 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 		 1102 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  30.8 
 
 		 719 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 		 1142 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1146 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1173 aa  65.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1079 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  34.86 
 
 		 1071 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  34.02 
 
 		 1101 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  28.01 
 
 		 1168 aa  64.7  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  34.38 
 
 		 1117 aa  64.3  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 993 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1038 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 1070 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 1023 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 979 aa  63.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  29.17 
 
 		 1025 aa  63.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  34.78 
 
 		 1114 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 924 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 1137 aa  62  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 887 aa  62  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>