130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08731 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  39.98 
 
 		 923 aa  729    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  52.04 
 
 		 928 aa  957    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  100 
 
 		 917 aa  1850    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  39.52 
 
 		 923 aa  711    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  37.32 
 
 		 803 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  37.24 
 
 		 793 aa  488  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  35.18 
 
 		 775 aa  487  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  35.02 
 
 		 786 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  36.41 
 
 		 787 aa  485  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  35.48 
 
 		 780 aa  478  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  36.33 
 
 		 775 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 790 aa  462  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  32.75 
 
 		 881 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 		 792 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  33.72 
 
 		 814 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 800 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  31.52 
 
 		 872 aa  439  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  34.45 
 
 		 791 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  34.91 
 
 		 772 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  34.27 
 
 		 800 aa  431  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 791 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 806 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 789 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 874 aa  355  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 804 aa  343  8e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 772 aa  316  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 875 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 852 aa  278  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 756 aa  249  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 		 753 aa  248  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 		 831 aa  164  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  23.27 
 
 		 888 aa  154  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  21.08 
 
 		 866 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  21.84 
 
 		 859 aa  84  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  21.84 
 
 		 791 aa  82  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 814 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 771 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  28.52 
 
 		 821 aa  72.4  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  24.81 
 
 		 1148 aa  71.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  22.46 
 
 		 797 aa  71.2  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  24.9 
 
 		 906 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  20.93 
 
 		 865 aa  68.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  20.83 
 
 		 897 aa  68.2  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  27.3 
 
 		 821 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  20.9 
 
 		 777 aa  66.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 781 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  22.66 
 
 		 781 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 865 aa  65.1  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  20.72 
 
 		 767 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 		 1060 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 935 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  21.99 
 
 		 701 aa  62.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  22.89 
 
 		 730 aa  62.4  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  25.3 
 
 		 822 aa  62.4  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  27.03 
 
 		 827 aa  59.7  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  24.81 
 
 		 1168 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  22.81 
 
 		 1127 aa  59.7  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 897 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  24.28 
 
 		 1145 aa  58.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0522  TonB-dependent receptor  21.72 
 
 		 727 aa  57  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.569695 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 792 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 800 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  22.18 
 
 		 743 aa  55.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  23.83 
 
 		 1155 aa  55.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 1038 aa  55.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 		 1082 aa  54.7  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  22.1 
 
 		 779 aa  54.7  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  22.99 
 
 		 848 aa  54.7  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  18.9 
 
 		 902 aa  54.7  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0595  putative outer membrane receptor signal peptide protein  22.34 
 
 		 729 aa  53.9  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.426057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02552  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.91 
 
 		 707 aa  54.3  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 1123 aa  52.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  22.47 
 
 		 1146 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 1034 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 952 aa  52  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 1087 aa  51.6  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  22.88 
 
 		 1168 aa  51.6  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4373  TonB-dependent receptor  21.01 
 
 		 730 aa  51.2  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 798 aa  51.2  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0783  TonB-dependent receptor  21.18 
 
 		 708 aa  51.2  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.285032  normal  0.0256294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 1176 aa  51.2  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  23.21 
 
 		 1164 aa  51.2  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 763 aa  51.2  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 966 aa  51.2  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  23.34 
 
 		 1102 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  25.1 
 
 		 803 aa  50.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  24.68 
 
 		 795 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 		 1062 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  26.07 
 
 		 788 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 1128 aa  50.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4789  hypothetical protein  26.07 
 
 		 587 aa  50.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0838792  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1096 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  21.77 
 
 		 1148 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  21.52 
 
 		 1173 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 		 760 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 1089 aa  49.3  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1084 aa  48.9  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  26.22 
 
 		 1117 aa  48.5  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 1175 aa  48.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  24.9 
 
 		 1087 aa  48.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>