162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06685 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  59.56 
 
 		 821 aa  1036    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  100 
 
 		 821 aa  1681    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  34.83 
 
 		 827 aa  489  1e-137  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  34.89 
 
 		 802 aa  463  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 792 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 814 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  30.03 
 
 		 872 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 793 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  32 
 
 		 780 aa  98.6  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 803 aa  97.4  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 790 aa  96.7  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 789 aa  96.3  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 791 aa  91.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 806 aa  91.7  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  25.66 
 
 		 800 aa  91.3  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 792 aa  90.9  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 923 aa  87.4  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1234  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 716 aa  85.5  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 772 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 923 aa  81.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 804 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 772 aa  79.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 756 aa  78.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 881 aa  79  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 775 aa  77.4  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 814 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 753 aa  75.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 791 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 875 aa  74.7  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  32.57 
 
 		 1064 aa  74.3  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 874 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  28.52 
 
 		 917 aa  72.8  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 787 aa  71.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 800 aa  70.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 		 730 aa  68.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 831 aa  67.8  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 775 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  26.82 
 
 		 928 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  30.92 
 
 		 1030 aa  66.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  23.67 
 
 		 865 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  24.66 
 
 		 859 aa  64.7  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 797 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  37.23 
 
 		 914 aa  61.6  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  24.26 
 
 		 859 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  24.53 
 
 		 860 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  24.22 
 
 		 1060 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 852 aa  58.9  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  24.84 
 
 		 1117 aa  58.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  23.58 
 
 		 719 aa  58.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 874 aa  58.2  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 735 aa  58.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 1114 aa  57.8  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  23.75 
 
 		 767 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  22.85 
 
 		 771 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  24.01 
 
 		 779 aa  57  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  29.05 
 
 		 1080 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1020 aa  56.6  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  29.5 
 
 		 1002 aa  55.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 935 aa  54.7  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4095  TonB-dependent receptor, plug  25.81 
 
 		 1123 aa  54.3  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0287  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  22.22 
 
 		 714 aa  54.3  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000460019  hitchhiker  0.00000346512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  23 
 
 		 888 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2101  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 1038 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.693236  normal  0.298537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 1040 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 887 aa  53.5  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 1105 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 1168 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 1026 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  21.86 
 
 		 897 aa  52.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 1103 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  22.87 
 
 		 1006 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 986 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 866 aa  52.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  24.23 
 
 		 769 aa  52.4  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 924 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1146 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 1003 aa  52  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 1090 aa  52  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  24.57 
 
 		 1071 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 786 aa  51.2  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1019 aa  50.8  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1021 aa  50.8  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  28.46 
 
 		 782 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  23.16 
 
 		 808 aa  50.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  30.4 
 
 		 1025 aa  50.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  22.43 
 
 		 791 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1173 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 1008 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 972 aa  49.7  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1087 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 1102 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1074 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1053 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1096 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  25.59 
 
 		 833 aa  49.3  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 1144 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 1013 aa  49.3  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 1038 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 1063 aa  48.9  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  26.98 
 
 		 806 aa  48.5  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>