165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0652 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 897 aa  1804    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  22.71 
 
 		 775 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  22.39 
 
 		 775 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 865 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  23.49 
 
 		 753 aa  104  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  21.48 
 
 		 793 aa  99  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  21.37 
 
 		 881 aa  98.2  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  27.71 
 
 		 888 aa  94.7  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  23.23 
 
 		 797 aa  94.4  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  25.21 
 
 		 872 aa  92  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  21.33 
 
 		 772 aa  90.9  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 831 aa  90.9  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 		 772 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  21.7 
 
 		 790 aa  89.4  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  22.08 
 
 		 800 aa  87.8  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  21.4 
 
 		 780 aa  87.8  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  23.85 
 
 		 800 aa  84.7  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 902 aa  81.6  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  21.42 
 
 		 789 aa  81.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  21.36 
 
 		 923 aa  81.6  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  21.17 
 
 		 800 aa  80.9  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 771 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  24.21 
 
 		 865 aa  79  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  21.06 
 
 		 791 aa  78.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 814 aa  77  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  26.87 
 
 		 822 aa  77.4  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  22.37 
 
 		 806 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  22.75 
 
 		 792 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  19.72 
 
 		 791 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  24.61 
 
 		 777 aa  73.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  21.35 
 
 		 787 aa  68.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  20.71 
 
 		 875 aa  68.2  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  20.83 
 
 		 917 aa  68.2  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  41.57 
 
 		 812 aa  67.8  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 781 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 1089 aa  64.3  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  34.91 
 
 		 787 aa  64.3  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1456  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 766 aa  63.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.271102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 781 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  40.23 
 
 		 815 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  21.81 
 
 		 804 aa  62  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  21.83 
 
 		 791 aa  62  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  22.02 
 
 		 821 aa  61.2  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  19.68 
 
 		 874 aa  61.2  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 792 aa  60.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  36.84 
 
 		 807 aa  60.1  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  22.9 
 
 		 859 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  41.89 
 
 		 1074 aa  59.3  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 1097 aa  58.9  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  36.84 
 
 		 973 aa  58.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  23.85 
 
 		 860 aa  58.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 935 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  23.39 
 
 		 814 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  34.67 
 
 		 1109 aa  56.6  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  21.72 
 
 		 767 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 743 aa  56.6  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  39.47 
 
 		 778 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  40.58 
 
 		 792 aa  55.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2186  TonB-dependent receptor  39.77 
 
 		 1040 aa  55.5  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.996858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  21.21 
 
 		 730 aa  54.7  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3280  TonB-dependent receptor  36.71 
 
 		 923 aa  54.7  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02552  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.63 
 
 		 707 aa  54.7  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235872  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  35.53 
 
 		 809 aa  54.7  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 819 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  22.65 
 
 		 1205 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0783  TonB-dependent receptor  21.21 
 
 		 708 aa  54.3  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.285032  normal  0.0256294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  33.03 
 
 		 856 aa  53.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  40.58 
 
 		 851 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4373  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 730 aa  53.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 		 879 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2231  secretin/TonB, short-like protein  38.04 
 
 		 206 aa  52.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  40.74 
 
 		 778 aa  52.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  39.44 
 
 		 1015 aa  52.8  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2126  TonB-dependent receptor  43.84 
 
 		 986 aa  52.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593846  normal  0.258054 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  21.86 
 
 		 821 aa  52.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  36.59 
 
 		 881 aa  52.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  36.59 
 
 		 921 aa  52  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  36.59 
 
 		 921 aa  52  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  36.59 
 
 		 881 aa  52.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  36.59 
 
 		 881 aa  52.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  31.52 
 
 		 844 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 888 aa  52  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  38.1 
 
 		 822 aa  52  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 841 aa  52  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  38.2 
 
 		 863 aa  52  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1126 aa  52  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  33.33 
 
 		 862 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 1147 aa  51.6  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  20.25 
 
 		 802 aa  51.6  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 948 aa  51.6  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0595  putative outer membrane receptor signal peptide protein  25.63 
 
 		 729 aa  51.2  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.426057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  34.91 
 
 		 858 aa  51.2  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  39.13 
 
 		 851 aa  51.2  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  39.13 
 
 		 813 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 966 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  39.68 
 
 		 808 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1109 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  32.99 
 
 		 810 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 811 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  24.52 
 
 		 859 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>