240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2186 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2186  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1040 aa  2122    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.996858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1523  TonB-dependent receptor  44.13 
 
 		 1045 aa  821    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4301  TonB-dependent receptor  46.44 
 
 		 1018 aa  904    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.15211 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 973 aa  426  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2303  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 982 aa  378  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243733  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2679  TonB-dependent receptor  35.32 
 
 		 1054 aa  325  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5620  putative extracellular heme-binding protein  34.01 
 
 		 930 aa  275  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  33.84 
 
 		 989 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  32.41 
 
 		 1186 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0566  heme receptor HasR  27.43 
 
 		 784 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3189  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 728 aa  125  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2389  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 823 aa  103  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.687523  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.54 
 
 		 892 aa  100  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.63 
 
 		 862 aa  98.2  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.1 
 
 		 862 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.89 
 
 		 862 aa  92  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  31.43 
 
 		 891 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  27.09 
 
 		 859 aa  89.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  31.43 
 
 		 885 aa  89  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.39 
 
 		 892 aa  88.6  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.02 
 
 		 849 aa  87  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  28.77 
 
 		 861 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.52 
 
 		 867 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  27.69 
 
 		 857 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  29.53 
 
 		 851 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  29.53 
 
 		 851 aa  75.5  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  35.94 
 
 		 779 aa  68.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  40.35 
 
 		 815 aa  68.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  30.12 
 
 		 813 aa  68.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  37.19 
 
 		 804 aa  67.8  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  32.41 
 
 		 759 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  29.71 
 
 		 774 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  36.97 
 
 		 743 aa  67.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  29.43 
 
 		 784 aa  67  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  35.48 
 
 		 717 aa  67  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.88 
 
 		 833 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  30.15 
 
 		 816 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  31.46 
 
 		 778 aa  65.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1988  TonB-dependent receptor  41.18 
 
 		 1020 aa  64.7  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  31.11 
 
 		 764 aa  64.7  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.84 
 
 		 677 aa  63.9  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  38.54 
 
 		 889 aa  64.3  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  37.04 
 
 		 810 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 774 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  31.78 
 
 		 764 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 793 aa  63.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  35.16 
 
 		 783 aa  63.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  31.5 
 
 		 778 aa  62.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3894  TonB-dependent heme receptor HasR  22.78 
 
 		 830 aa  62.4  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0130  TonB-dependent heme receptor HasR  22.78 
 
 		 830 aa  62.4  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.71 
 
 		 734 aa  62.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4086  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  20.59 
 
 		 783 aa  62  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  38.1 
 
 		 812 aa  62  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  39.13 
 
 		 839 aa  61.2  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3466  TonB-dependent receptor  21.91 
 
 		 747 aa  61.2  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  34.48 
 
 		 819 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  37.37 
 
 		 821 aa  60.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  40.95 
 
 		 778 aa  60.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 809 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22 
 
 		 697 aa  60.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.89 
 
 		 669 aa  60.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  36.13 
 
 		 802 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  37.36 
 
 		 804 aa  59.7  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.57 
 
 		 685 aa  58.9  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 		 801 aa  58.9  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  33.7 
 
 		 807 aa  58.9  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  27.99 
 
 		 809 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 809 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 829 aa  58.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  39.44 
 
 		 864 aa  58.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  39.51 
 
 		 804 aa  58.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  36.46 
 
 		 801 aa  57.8  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 810 aa  58.2  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  25.46 
 
 		 828 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 810 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  37.27 
 
 		 808 aa  57.4  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 777 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  38.71 
 
 		 826 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  32.87 
 
 		 817 aa  57  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  36.67 
 
 		 806 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  25.76 
 
 		 782 aa  57  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3280  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 923 aa  57.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  33.82 
 
 		 808 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 811 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 809 aa  56.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  35.96 
 
 		 797 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  42.11 
 
 		 822 aa  55.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  33.64 
 
 		 824 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 973 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  25 
 
 		 883 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  33.82 
 
 		 808 aa  55.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 		 797 aa  55.5  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  38.46 
 
 		 897 aa  55.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  33.33 
 
 		 812 aa  55.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 		 821 aa  55.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30.77 
 
 		 722 aa  55.5  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0658  secretin/TonB  35.56 
 
 		 507 aa  55.5  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1599  TonB-dependent receptor, plug  30.16 
 
 		 800 aa  55.1  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000304489  unclonable  0.000000404036 
 
 
 
NC_008309  HS_0181  TonB-dependent outer membrane receptor  29.6 
 
 		 915 aa  55.1  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  35.79 
 
 		 808 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>