More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_64710 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5620  putative extracellular heme-binding protein  86.73 
 
 
930 aa  1662    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  100 
 
 
989 aa  2021    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2303  TonB-dependent receptor  36.86 
 
 
982 aa  590  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243733  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  38.48 
 
 
973 aa  584  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4301  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 
1018 aa  392  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.15211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2679  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 
1054 aa  378  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  33.18 
 
 
1186 aa  277  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2186  TonB-dependent receptor  32.98 
 
 
1040 aa  264  6.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.996858  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1523  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 
1045 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.86 
 
 
892 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.05 
 
 
892 aa  174  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3189  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 
728 aa  172  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0566  heme receptor HasR  31.75 
 
 
784 aa  172  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  29.69 
 
 
891 aa  115  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  28.8 
 
 
885 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.83 
 
 
849 aa  104  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.27 
 
 
669 aa  101  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  29.96 
 
 
861 aa  99  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  25.55 
 
 
851 aa  97.8  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  24.8 
 
 
851 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.07 
 
 
867 aa  96.3  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  30.94 
 
 
857 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  26.21 
 
 
778 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.6 
 
 
862 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  31.47 
 
 
862 aa  92.4  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  28.83 
 
 
859 aa  91.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 
799 aa  91.3  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.22 
 
 
779 aa  90.9  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2389  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 
823 aa  90.5  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.687523  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.42 
 
 
717 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  35.14 
 
 
799 aa  89.4  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.6 
 
 
862 aa  89  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.87 
 
 
778 aa  88.6  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  35.14 
 
 
799 aa  89  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
828 aa  86.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 
782 aa  84.7  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  35.71 
 
 
816 aa  84.7  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  32.14 
 
 
782 aa  84.3  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  31.91 
 
 
804 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.77 
 
 
783 aa  84.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.43 
 
 
685 aa  83.2  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  30.05 
 
 
825 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  33.77 
 
 
804 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 
806 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3894  TonB-dependent heme receptor HasR  26.51 
 
 
830 aa  81.6  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0130  TonB-dependent heme receptor HasR  26.51 
 
 
830 aa  81.6  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4086  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.51 
 
 
783 aa  81.3  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  34.5 
 
 
774 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.86 
 
 
743 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  32.04 
 
 
828 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 
809 aa  79  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  35.61 
 
 
764 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  35.88 
 
 
764 aa  79  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.7 
 
 
833 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 
802 aa  78.2  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.84 
 
 
734 aa  78.2  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  34.3 
 
 
821 aa  77.8  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  34.86 
 
 
784 aa  77  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 
795 aa  77.4  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 
822 aa  77.8  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  29.92 
 
 
787 aa  76.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  29.95 
 
 
808 aa  75.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  34.09 
 
 
774 aa  75.1  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.46 
 
 
722 aa  74.7  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  32.04 
 
 
759 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 
800 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0115  tonB-dependent receptor  25.24 
 
 
753 aa  72.4  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  29.11 
 
 
809 aa  72.4  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  37.41 
 
 
817 aa  72.4  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3466  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 
747 aa  72.4  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4077  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 
959 aa  72.4  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 
777 aa  72  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  27.98 
 
 
801 aa  71.6  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  27.98 
 
 
801 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  32.26 
 
 
810 aa  71.2  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  30.05 
 
 
806 aa  70.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  30.14 
 
 
828 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  31.42 
 
 
816 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  35.97 
 
 
808 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  28.38 
 
 
774 aa  68.9  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  28.38 
 
 
774 aa  68.9  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  34.51 
 
 
802 aa  69.3  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 
774 aa  69.3  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  30.94 
 
 
809 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  28.38 
 
 
774 aa  68.9  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 
794 aa  68.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0171  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  25.94 
 
 
755 aa  68.6  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  30.94 
 
 
809 aa  68.6  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  32.67 
 
 
810 aa  68.2  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  25.71 
 
 
812 aa  68.2  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 
793 aa  68.2  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  26.01 
 
 
789 aa  67.8  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 
774 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1051  TonB-dependent outer membrane receptor  24.21 
 
 
757 aa  67.4  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.84 
 
 
677 aa  67.8  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  33.33 
 
 
712 aa  67  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 
820 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2383  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 
926 aa  66.6  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  46.48 
 
 
826 aa  67  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  32.43 
 
 
784 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>