More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5620 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5620  putative extracellular heme-binding protein  100 
 
 
930 aa  1896    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  86.73 
 
 
989 aa  1661    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2303  TonB-dependent receptor  38.62 
 
 
982 aa  590  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243733  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  37.58 
 
 
973 aa  548  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4301  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 
1018 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.15211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1523  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 
1045 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  33.73 
 
 
1186 aa  273  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2679  TonB-dependent receptor  33.28 
 
 
1054 aa  270  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2186  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 
1040 aa  269  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.996858  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.39 
 
 
892 aa  191  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0566  heme receptor HasR  29.93 
 
 
784 aa  181  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3189  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 
728 aa  170  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.33 
 
 
892 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  28.09 
 
 
891 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  27.53 
 
 
885 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  24.86 
 
 
778 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  32.33 
 
 
861 aa  107  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.14 
 
 
849 aa  107  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2389  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 
823 aa  104  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.687523  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.79 
 
 
669 aa  103  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  32.13 
 
 
862 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.57 
 
 
778 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  32.13 
 
 
862 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.58 
 
 
779 aa  99.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.9 
 
 
867 aa  97.8  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  31.47 
 
 
862 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  26.28 
 
 
851 aa  95.5  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  25.61 
 
 
851 aa  94  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.29 
 
 
685 aa  90.9  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 
809 aa  89.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  30.92 
 
 
859 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
799 aa  89.4  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
799 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  35.48 
 
 
816 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
799 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3894  TonB-dependent heme receptor HasR  26.85 
 
 
830 aa  85.5  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0130  TonB-dependent heme receptor HasR  26.85 
 
 
830 aa  85.1  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4086  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.85 
 
 
783 aa  85.1  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  31.2 
 
 
857 aa  84.7  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.22 
 
 
717 aa  84  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  45.74 
 
 
817 aa  82  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  28.83 
 
 
783 aa  82  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  37.12 
 
 
764 aa  81.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  34.76 
 
 
759 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.08 
 
 
722 aa  80.1  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  36.36 
 
 
764 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.19 
 
 
734 aa  78.2  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  30.74 
 
 
804 aa  77.8  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  34.71 
 
 
784 aa  77.4  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  30.61 
 
 
804 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  28.99 
 
 
782 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  33.72 
 
 
774 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  29.49 
 
 
782 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 
800 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3466  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 
747 aa  75.5  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  27.85 
 
 
802 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0115  tonB-dependent receptor  27.27 
 
 
753 aa  75.1  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  28.16 
 
 
801 aa  74.7  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  28.16 
 
 
801 aa  74.7  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29 
 
 
743 aa  74.3  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  32.09 
 
 
809 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 
806 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0171  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  27.31 
 
 
755 aa  73.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.47 
 
 
661 aa  73.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1051  TonB-dependent outer membrane receptor  24.9 
 
 
757 aa  73.6  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.18 
 
 
681 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 
828 aa  72  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  31.32 
 
 
809 aa  71.6  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  32.76 
 
 
774 aa  71.6  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 
809 aa  71.2  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  34.68 
 
 
712 aa  70.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  43.68 
 
 
779 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 
787 aa  69.7  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  37.86 
 
 
833 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  26.42 
 
 
771 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  0.000000514373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  31.11 
 
 
816 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  29.12 
 
 
807 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 
794 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  30.38 
 
 
828 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  33.92 
 
 
784 aa  68.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  46.05 
 
 
822 aa  68.2  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  25.66 
 
 
660 aa  67.8  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  32.24 
 
 
810 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  33.33 
 
 
784 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  30.25 
 
 
808 aa  67.4  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  25.66 
 
 
660 aa  67.8  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.69 
 
 
677 aa  67  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 
797 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  36.36 
 
 
821 aa  66.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 
828 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 
795 aa  66.6  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  30.6 
 
 
809 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  32.72 
 
 
688 aa  65.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4077  cyclic nucleotide-binding protein  26.61 
 
 
959 aa  65.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 
820 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  37.5 
 
 
802 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 
665 aa  65.1  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  30.14 
 
 
813 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.11 
 
 
696 aa  65.1  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 
793 aa  64.7  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>