More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4077 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4077  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 959 aa  1950    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3961  TonB-dependent receptor  32.92 
 
 		 835 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04790  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 793 aa  346  1e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3280  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 923 aa  308  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 866 aa  303  9e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0305  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 786 aa  295  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.301005 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1484  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 831 aa  277  6e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.135772  normal  0.425755 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3957  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 870 aa  270  8e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  26.96 
 
 		 864 aa  268  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 882 aa  239  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02415  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 814 aa  213  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2959  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 761 aa  211  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.404716 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1434  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 753 aa  211  8e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000294975  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0977  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 757 aa  207  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1822  TonB-dependent receptor, plug  25.74 
 
 		 756 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000398859  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3503  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 754 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3988  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 798 aa  187  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000235152  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0068  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 798 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00237309  hitchhiker  0.00396946 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0063  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 798 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0128619  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4286  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 798 aa  184  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000018092  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0067  outer membrane insertion C-terminal signal  25.45 
 
 		 798 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00013463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3963  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 812 aa  181  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000386767  normal  0.0993256 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0066  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 798 aa  177  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206959  hitchhiker  0.0000000155765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0064  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 798 aa  177  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00224959  unclonable  0.0000416662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0068  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 798 aa  177  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000121546  unclonable  0.000000000240632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02625  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 836 aa  159  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0334  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 815 aa  152  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000617894  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3229  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 875 aa  140  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0866  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 879 aa  130  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.250778  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1881  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 838 aa  123  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.490789  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03378  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 798 aa  119  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0156374  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2383  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 926 aa  99  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  21.8 
 
 		 792 aa  96.3  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 833 aa  92.4  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 828 aa  92.4  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.09 
 
 		 833 aa  88.6  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  29.25 
 
 		 802 aa  88.2  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0725  TonB-dependent receptor protein  27.3 
 
 		 633 aa  87.4  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  26.28 
 
 		 828 aa  84.7  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 841 aa  84.7  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  30.8 
 
 		 816 aa  84.3  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  29.08 
 
 		 787 aa  84  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  28.62 
 
 		 864 aa  84  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  27.59 
 
 		 812 aa  83.2  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  29.71 
 
 		 797 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 836 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 799 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 		 841 aa  82  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 817 aa  82  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 		 778 aa  81.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  30.34 
 
 		 813 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 		 828 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  28.93 
 
 		 808 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  25.33 
 
 		 828 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 828 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  27.87 
 
 		 828 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 799 aa  78.2  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  25.2 
 
 		 841 aa  77.8  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 799 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  28.31 
 
 		 812 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  25.39 
 
 		 794 aa  76.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  24.94 
 
 		 829 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 757 aa  75.5  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 812 aa  75.5  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 883 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 817 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  24.42 
 
 		 807 aa  74.3  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  26.22 
 
 		 799 aa  73.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  23.65 
 
 		 802 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 		 814 aa  73.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.59 
 
 		 862 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  29.21 
 
 		 989 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 824 aa  72.4  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  25.09 
 
 		 797 aa  72.4  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 815 aa  72  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.59 
 
 		 862 aa  72  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  26.35 
 
 		 518 aa  71.6  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 		 797 aa  71.6  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  28.52 
 
 		 816 aa  71.6  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  24.65 
 
 		 797 aa  71.2  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 825 aa  71.2  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  22.11 
 
 		 806 aa  71.2  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  27.36 
 
 		 819 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 		 793 aa  70.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 798 aa  70.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  22.55 
 
 		 808 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  25.9 
 
 		 808 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 778 aa  70.1  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  27.44 
 
 		 797 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  25.52 
 
 		 821 aa  69.7  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1988  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 1020 aa  70.1  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  23.97 
 
 		 844 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 		 808 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  25.87 
 
 		 802 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  23.92 
 
 		 795 aa  69.7  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.57 
 
 		 825 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  27.34 
 
 		 803 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  29.36 
 
 		 739 aa  68.6  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29.94 
 
 		 653 aa  68.2  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  30.43 
 
 		 812 aa  67.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>