291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1814 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3894  TonB-dependent heme receptor HasR  51.4 
 
 
830 aa  791    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  92.15 
 
 
892 aa  1716    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4086  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  51.4 
 
 
783 aa  791    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  100 
 
 
892 aa  1841    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0130  TonB-dependent heme receptor HasR  51.28 
 
 
830 aa  790    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  44.95 
 
 
885 aa  718    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  45.11 
 
 
891 aa  723    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.22 
 
 
722 aa  207  9e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.51 
 
 
717 aa  189  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.47 
 
 
779 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.81 
 
 
778 aa  187  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.93 
 
 
743 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.44 
 
 
669 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  26.08 
 
 
778 aa  183  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.14 
 
 
734 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  24.05 
 
 
989 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.63 
 
 
783 aa  168  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5620  putative extracellular heme-binding protein  24.33 
 
 
930 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253718  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.22 
 
 
1186 aa  162  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.07 
 
 
685 aa  159  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.14 
 
 
696 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.25 
 
 
696 aa  146  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.38 
 
 
696 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.52 
 
 
661 aa  139  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.47 
 
 
696 aa  138  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26 
 
 
695 aa  138  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  27.27 
 
 
660 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  27.09 
 
 
660 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  24.32 
 
 
697 aa  135  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.68 
 
 
676 aa  134  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.25 
 
 
696 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  26.42 
 
 
676 aa  129  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0115  tonB-dependent receptor  23.95 
 
 
753 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2389  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 
823 aa  128  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.687523  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.24 
 
 
676 aa  127  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  26.24 
 
 
676 aa  127  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.36 
 
 
694 aa  127  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.76 
 
 
690 aa  127  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.5 
 
 
688 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3466  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 
747 aa  119  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.87 
 
 
681 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  23.14 
 
 
857 aa  114  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.13 
 
 
859 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0171  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  23.23 
 
 
755 aa  110  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2303  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 
982 aa  109  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243733  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.85 
 
 
862 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.75 
 
 
704 aa  106  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.36 
 
 
861 aa  106  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.21 
 
 
867 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.65 
 
 
862 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1051  TonB-dependent outer membrane receptor  25.29 
 
 
757 aa  102  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  22.35 
 
 
851 aa  97.4  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1523  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 
1045 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  22.28 
 
 
851 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.4 
 
 
697 aa  95.9  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.03 
 
 
862 aa  95.5  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.47 
 
 
849 aa  94  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4301  TonB-dependent receptor  22.35 
 
 
1018 aa  93.2  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.15211 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 
973 aa  92.4  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2679  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 
1054 aa  92  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.07 
 
 
694 aa  91.3  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.69 
 
 
677 aa  90.9  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0566  heme receptor HasR  24.05 
 
 
784 aa  89  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2186  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 
1040 aa  86.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.996858  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  22.21 
 
 
764 aa  81.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  32.3 
 
 
807 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3189  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 
728 aa  78.2  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.81 
 
 
714 aa  77.8  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  21.94 
 
 
764 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.3 
 
 
759 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3124  TonB-dependent receptor  22.18 
 
 
791 aa  77  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 
649 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  25.77 
 
 
815 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  28.07 
 
 
821 aa  72.8  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 
778 aa  71.2  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  27.63 
 
 
809 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 
809 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 
809 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0181  TonB-dependent outer membrane receptor  24.04 
 
 
915 aa  69.3  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 
778 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  25.34 
 
 
812 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  23.25 
 
 
668 aa  68.9  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1239  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.75 
 
 
646 aa  68.2  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 
809 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  25.27 
 
 
828 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  24.91 
 
 
828 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  25.98 
 
 
782 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  32.61 
 
 
712 aa  66.6  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  27.43 
 
 
771 aa  66.2  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  0.000000514373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  25.81 
 
 
808 aa  65.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 
817 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3030  putaive Fe-regulated protein B precursor  28.57 
 
 
693 aa  65.1  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000310305  hitchhiker  0.000241006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  29.23 
 
 
863 aa  65.1  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0728  hemin receptor, outer membrane protein  30.41 
 
 
314 aa  64.3  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  26.06 
 
 
782 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3082  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.77 
 
 
730 aa  63.9  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25355  normal  0.407735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 
808 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 
817 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  24.91 
 
 
777 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1564  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 
654 aa  63.2  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.364337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>