More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4191 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  100 
 
 
734 aa  1500    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  47.03 
 
 
778 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  46.19 
 
 
783 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  44.87 
 
 
778 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  44.65 
 
 
779 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  37.99 
 
 
722 aa  444  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  36.46 
 
 
717 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  35.99 
 
 
743 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  32.97 
 
 
685 aa  332  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.62 
 
 
669 aa  247  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.49 
 
 
681 aa  238  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.18 
 
 
688 aa  231  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.21 
 
 
696 aa  226  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.39 
 
 
696 aa  217  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.25 
 
 
696 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  27.73 
 
 
676 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.56 
 
 
695 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  28.15 
 
 
690 aa  209  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.1 
 
 
696 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.96 
 
 
696 aa  207  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  28.02 
 
 
697 aa  205  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  27.4 
 
 
891 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  27.31 
 
 
885 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.67 
 
 
892 aa  183  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  24.89 
 
 
660 aa  182  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3894  TonB-dependent heme receptor HasR  23.95 
 
 
830 aa  182  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  24.89 
 
 
660 aa  182  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0130  TonB-dependent heme receptor HasR  23.83 
 
 
830 aa  181  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.14 
 
 
892 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4086  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.12 
 
 
783 aa  176  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.68 
 
 
661 aa  176  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.21 
 
 
694 aa  171  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.73 
 
 
689 aa  160  8e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  24.64 
 
 
676 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  25.68 
 
 
676 aa  140  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.68 
 
 
676 aa  140  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.42 
 
 
704 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.02 
 
 
657 aa  134  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0115  tonB-dependent receptor  22.49 
 
 
753 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  24.66 
 
 
652 aa  117  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  24.63 
 
 
712 aa  117  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.64 
 
 
686 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1858  heme transport protein HugA  23.73 
 
 
683 aa  115  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 
698 aa  113  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2389  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 
823 aa  113  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.687523  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3466  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 
747 aa  111  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  25 
 
 
716 aa  110  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  21.4 
 
 
714 aa  108  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2503  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  21.95 
 
 
744 aa  106  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.955771  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03722  outer membrane hemin receptor signal peptide protein  25.03 
 
 
741 aa  103  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000281288  normal  0.0836882 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  23.84 
 
 
656 aa  103  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  23.93 
 
 
650 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.71 
 
 
849 aa  102  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0347  TonB-dependent receptor, plug  23.6 
 
 
670 aa  101  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000326  enterobactin receptor VctA  24.54 
 
 
668 aa  100  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000334593  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 
649 aa  100  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0389  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 
667 aa  100  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  23.35 
 
 
663 aa  99  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  25.54 
 
 
490 aa  99  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  21.15 
 
 
698 aa  99  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0221  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  24.13 
 
 
755 aa  98.6  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1599  TonB-dependent receptor, plug  23.64 
 
 
800 aa  98.2  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000304489  unclonable  0.000000404036 
 
 
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.49 
 
 
666 aa  97.8  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  22.78 
 
 
663 aa  96.7  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004277  TonB-dependent heme receptor  23.33 
 
 
730 aa  96.3  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  22.51 
 
 
693 aa  95.9  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1420  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.87 
 
 
739 aa  94.7  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.330075  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  23.22 
 
 
666 aa  94  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  23.21 
 
 
666 aa  94  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 
702 aa  94  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5431  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  24.08 
 
 
755 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5431  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.08 
 
 
755 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469015  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1093  TonB dependent receptor domain-containing protein  24.57 
 
 
654 aa  92.8  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  23.38 
 
 
666 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  23.21 
 
 
666 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 
681 aa  92.4  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1190  TonB dependent receptor domain-containing protein  24.57 
 
 
661 aa  92.4  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0340628  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  29.86 
 
 
771 aa  92.4  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  0.000000514373 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4772  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.17 
 
 
769 aa  92.4  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784759  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1580  TonB-dependent heme receptor  23.59 
 
 
737 aa  91.7  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 
627 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1381  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.59 
 
 
739 aa  91.3  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 
698 aa  90.9  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 
698 aa  90.9  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1397  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.38 
 
 
739 aa  90.9  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.22 
 
 
677 aa  90.9  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 
698 aa  90.9  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2957  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.59 
 
 
739 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.910627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  23.51 
 
 
653 aa  89.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0996  enterobactin receptor VctA  23.18 
 
 
659 aa  90.5  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000420276  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.58 
 
 
694 aa  89.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 
681 aa  89.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4838  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.27 
 
 
757 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2610  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 
665 aa  89  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.846582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1308  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.28 
 
 
737 aa  88.6  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0449  transferrin-binding protein A  31.09 
 
 
992 aa  88.2  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0459359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  23.23 
 
 
653 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  23.1 
 
 
635 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3079  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.34 
 
 
749 aa  87.8  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578184  normal  0.640721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  36.53 
 
 
1186 aa  87.8  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>