72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0566 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0566  heme receptor HasR  100 
 
 		 784 aa  1631    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3189  TonB-dependent receptor  40.28 
 
 		 728 aa  544  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25 
 
 		 1186 aa  188  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5620  putative extracellular heme-binding protein  29.93 
 
 		 930 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253718  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 973 aa  180  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  31.75 
 
 		 989 aa  172  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1523  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 1045 aa  157  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2303  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 982 aa  156  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243733  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2679  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 1054 aa  145  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4301  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 1018 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.15211 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2186  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 1040 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.996858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  23.91 
 
 		 885 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  23.37 
 
 		 891 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  21.31 
 
 		 778 aa  97.8  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  21.79 
 
 		 778 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.57 
 
 		 892 aa  94.7  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0130  TonB-dependent heme receptor HasR  22.6 
 
 		 830 aa  93.2  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.05 
 
 		 892 aa  89  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.17 
 
 		 779 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3894  TonB-dependent heme receptor HasR  22.37 
 
 		 830 aa  87  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.34 
 
 		 783 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4086  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.72 
 
 		 783 aa  85.5  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.38 
 
 		 669 aa  77.8  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1051  TonB-dependent outer membrane receptor  22.15 
 
 		 757 aa  76.6  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2389  TonB-dependent receptor  20.78 
 
 		 823 aa  73.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.687523  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0115  tonB-dependent receptor  22.28 
 
 		 753 aa  72  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.01 
 
 		 743 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.82 
 
 		 717 aa  67.8  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.68 
 
 		 696 aa  64.7  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  32.73 
 
 		 734 aa  63.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.96 
 
 		 696 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.36 
 
 		 685 aa  61.2  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.82 
 
 		 695 aa  60.8  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  21.47 
 
 		 716 aa  57.8  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.44 
 
 		 681 aa  57.4  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.12 
 
 		 676 aa  57.4  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 681 aa  56.2  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.69 
 
 		 677 aa  56.6  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  28.32 
 
 		 712 aa  55.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.01 
 
 		 704 aa  55.1  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  21.72 
 
 		 689 aa  54.7  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.51 
 
 		 688 aa  53.9  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.08 
 
 		 696 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  31.54 
 
 		 764 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  33.33 
 
 		 722 aa  52.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3466  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 747 aa  51.6  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  24.06 
 
 		 693 aa  51.6  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  30.41 
 
 		 764 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.38 
 
 		 661 aa  49.7  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  29.12 
 
 		 690 aa  50.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  29.49 
 
 		 697 aa  49.7  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1564  TonB-dependent receptor  20.66 
 
 		 654 aa  49.3  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.364337  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 782 aa  48.9  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  37.65 
 
 		 698 aa  48.5  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.57 
 
 		 859 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2503  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  21.96 
 
 		 744 aa  47.8  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.955771  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.67 
 
 		 676 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  21.67 
 
 		 676 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03722  outer membrane hemin receptor signal peptide protein  22.01 
 
 		 741 aa  46.2  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000281288  normal  0.0836882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  28.67 
 
 		 861 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  21.67 
 
 		 676 aa  46.2  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  22.84 
 
 		 660 aa  45.8  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  22.09 
 
 		 490 aa  45.8  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  22.84 
 
 		 660 aa  45.8  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  21.21 
 
 		 697 aa  45.4  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  33.91 
 
 		 696 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 699 aa  45.4  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  25 
 
 		 611 aa  45.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.45 
 
 		 686 aa  45.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  23.75 
 
 		 709 aa  45.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0171  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  26.06 
 
 		 755 aa  44.7  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0449  transferrin-binding protein A  25.93 
 
 		 992 aa  43.9  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0459359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>