More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3918 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  100 
 
 
681 aa  1391    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3414  TonB-dependent receptor  47.16 
 
 
687 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  41.53 
 
 
649 aa  504  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  41.24 
 
 
657 aa  495  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  39.96 
 
 
490 aa  360  6e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 
668 aa  310  5.9999999999999995e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.6 
 
 
677 aa  283  9e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000326  enterobactin receptor VctA  29.18 
 
 
668 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000334593  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  28.61 
 
 
697 aa  254  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  31.7 
 
 
652 aa  254  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0996  enterobactin receptor VctA  27.71 
 
 
659 aa  238  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000420276  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3030  putaive Fe-regulated protein B precursor  26.43 
 
 
693 aa  221  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000310305  hitchhiker  0.000241006 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.8 
 
 
681 aa  206  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2159  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 
684 aa  204  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.88 
 
 
690 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1564  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 
654 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.364337  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.21 
 
 
688 aa  193  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2610  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 
665 aa  190  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.846582 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1239  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.3 
 
 
646 aa  188  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0389  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 
667 aa  183  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  25.2 
 
 
668 aa  182  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4401  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 
756 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78723  normal  0.0995472 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.97 
 
 
696 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1906  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 
693 aa  178  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2622  TonB-dependent receptor plug  25.59 
 
 
743 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00560047  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.4 
 
 
696 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.93 
 
 
696 aa  173  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1945  TonB-dependent receptor, plug  35.42 
 
 
300 aa  172  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583164  normal  0.445387 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.46 
 
 
695 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1190  TonB dependent receptor domain-containing protein  25.32 
 
 
661 aa  172  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0340628  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.18 
 
 
696 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  26.24 
 
 
676 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1093  TonB dependent receptor domain-containing protein  25.04 
 
 
654 aa  169  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  24.34 
 
 
697 aa  167  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4268  GntR domain-containing protein  25.97 
 
 
644 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.04 
 
 
696 aa  165  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3784  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 
644 aa  160  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3056  TonB dependent-iron siderophore receptor  24.21 
 
 
644 aa  158  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1306  iron-regulated outer membrane protein  24.76 
 
 
692 aa  155  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000656516  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2296  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 
752 aa  154  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0296  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 
652 aa  153  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1943  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 
374 aa  147  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.330013  normal  0.348823 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1858  heme transport protein HugA  25.83 
 
 
683 aa  147  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1397  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.71 
 
 
739 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1381  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.58 
 
 
739 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0387  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 
683 aa  144  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.84983  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1308  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.9 
 
 
737 aa  144  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1420  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.29 
 
 
739 aa  144  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.330075  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2957  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.93 
 
 
739 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.910627 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1580  TonB-dependent heme receptor  25.4 
 
 
737 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2862  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.21 
 
 
737 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0664764 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004277  TonB-dependent heme receptor  24.11 
 
 
730 aa  135  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2503  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.36 
 
 
744 aa  124  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.955771  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.17 
 
 
704 aa  118  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.37 
 
 
685 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.86 
 
 
694 aa  113  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.25 
 
 
689 aa  108  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.06 
 
 
783 aa  107  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.84 
 
 
849 aa  104  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.9 
 
 
778 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.8 
 
 
717 aa  101  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  23.27 
 
 
771 aa  101  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  0.000000514373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.38 
 
 
862 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  23.57 
 
 
778 aa  98.2  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 
617 aa  98.2  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  26.06 
 
 
861 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06116  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  97.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.86 
 
 
743 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.35 
 
 
779 aa  94  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  35.2 
 
 
712 aa  93.6  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.13 
 
 
734 aa  92.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3271  outer membrane heme receptor  24.16 
 
 
728 aa  92.4  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403034  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  22.66 
 
 
698 aa  91.3  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.24 
 
 
686 aa  91.7  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.28 
 
 
862 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.16 
 
 
862 aa  90.9  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  24.07 
 
 
572 aa  90.9  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.22 
 
 
859 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.66 
 
 
661 aa  89.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  24.12 
 
 
693 aa  88.2  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0347  TonB-dependent receptor, plug  21.86 
 
 
670 aa  87.4  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.8 
 
 
867 aa  87  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.23 
 
 
669 aa  85.9  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.96 
 
 
759 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  23.29 
 
 
712 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1599  TonB-dependent receptor, plug  31.28 
 
 
800 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000304489  unclonable  0.000000404036 
 
 
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  23.49 
 
 
857 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.28 
 
 
722 aa  82.4  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  22.88 
 
 
660 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  23.26 
 
 
764 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.59 
 
 
714 aa  81.6  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  21.23 
 
 
716 aa  80.9  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  22.73 
 
 
660 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  24.86 
 
 
628 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3079  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.58 
 
 
749 aa  79  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578184  normal  0.640721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5070  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.33 
 
 
762 aa  78.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565094  normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  23.2 
 
 
851 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  25.31 
 
 
727 aa  77.4  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.94 
 
 
616 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 
698 aa  77  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>