More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1017 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  100 
 
 
704 aa  1414    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  39.39 
 
 
689 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  35.07 
 
 
686 aa  328  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0347  TonB-dependent receptor, plug  32.59 
 
 
670 aa  310  4e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  28.92 
 
 
676 aa  227  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.57 
 
 
849 aa  210  9e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.92 
 
 
688 aa  187  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.37 
 
 
717 aa  185  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.42 
 
 
669 aa  184  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.27 
 
 
681 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.86 
 
 
696 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.15 
 
 
696 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.01 
 
 
696 aa  173  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  26.91 
 
 
660 aa  172  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.07 
 
 
696 aa  171  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  26.61 
 
 
660 aa  171  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2862  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.55 
 
 
737 aa  169  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0664764 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.15 
 
 
696 aa  168  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.32 
 
 
778 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.04 
 
 
690 aa  165  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1599  TonB-dependent receptor, plug  24.12 
 
 
800 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000304489  unclonable  0.000000404036 
 
 
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.72 
 
 
694 aa  163  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1580  TonB-dependent heme receptor  24.97 
 
 
737 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.86 
 
 
695 aa  162  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.01 
 
 
661 aa  162  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1308  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25 
 
 
737 aa  161  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.46 
 
 
779 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.1 
 
 
685 aa  159  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  24.93 
 
 
697 aa  158  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  25.47 
 
 
778 aa  157  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1397  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.93 
 
 
739 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.13 
 
 
722 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  26.47 
 
 
676 aa  154  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.19 
 
 
743 aa  154  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1420  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.18 
 
 
739 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.330075  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  26.62 
 
 
676 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  24.23 
 
 
771 aa  152  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  0.000000514373 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.62 
 
 
676 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1381  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.04 
 
 
739 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2503  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.72 
 
 
744 aa  152  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.955771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  23.7 
 
 
851 aa  152  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2957  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.18 
 
 
739 aa  151  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.910627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  24.57 
 
 
851 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  26.32 
 
 
652 aa  146  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.93 
 
 
716 aa  141  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.4 
 
 
677 aa  140  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.77 
 
 
697 aa  140  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  25.95 
 
 
693 aa  140  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.42 
 
 
734 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.7 
 
 
783 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  25.07 
 
 
698 aa  135  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  25 
 
 
885 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  25.59 
 
 
891 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  24.5 
 
 
668 aa  127  8.000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1239  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.78 
 
 
646 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1858  heme transport protein HugA  23.37 
 
 
683 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0996  enterobactin receptor VctA  24.15 
 
 
659 aa  121  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000420276  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.49 
 
 
694 aa  121  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000326  enterobactin receptor VctA  23.42 
 
 
668 aa  121  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000334593  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 
681 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  24.44 
 
 
490 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  27.01 
 
 
859 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 
649 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004277  TonB-dependent heme receptor  21.23 
 
 
730 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.49 
 
 
892 aa  110  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  25.45 
 
 
764 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  25.1 
 
 
764 aa  108  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.75 
 
 
892 aa  107  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  25.19 
 
 
861 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.34 
 
 
728 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.4 
 
 
862 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.36 
 
 
862 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.61 
 
 
862 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03722  outer membrane hemin receptor signal peptide protein  25.9 
 
 
741 aa  101  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000281288  normal  0.0836882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2813  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.13 
 
 
752 aa  101  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409295  normal  0.033455 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4268  GntR domain-containing protein  25.86 
 
 
644 aa  101  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.2 
 
 
759 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  24.04 
 
 
628 aa  100  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3079  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.8 
 
 
749 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578184  normal  0.640721 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2610  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 
665 aa  98.6  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.846582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  25.96 
 
 
857 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.67 
 
 
657 aa  98.2  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  23.92 
 
 
617 aa  96.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.29 
 
 
867 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0728  hemin receptor, outer membrane protein  33.51 
 
 
314 aa  95.5  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.47 
 
 
714 aa  95.5  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1093  TonB dependent receptor domain-containing protein  22.19 
 
 
654 aa  95.1  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1190  TonB dependent receptor domain-containing protein  22.29 
 
 
661 aa  94.4  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0340628  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3030  putaive Fe-regulated protein B precursor  23.59 
 
 
693 aa  94  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000310305  hitchhiker  0.000241006 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  32.12 
 
 
712 aa  94  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  23.66 
 
 
639 aa  93.6  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 
688 aa  93.6  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1111  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.33 
 
 
754 aa  93.6  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2929  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.61 
 
 
755 aa  92.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.56728  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 
668 aa  92.4  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 
641 aa  91.7  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 
828 aa  91.3  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1564  TonB-dependent receptor  25 
 
 
654 aa  90.1  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.364337  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3894  TonB-dependent heme receptor HasR  22.38 
 
 
830 aa  90.1  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0130  TonB-dependent heme receptor HasR  22.14 
 
 
830 aa  89.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>