More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2380 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 782 aa  1596    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1838  TonB-dependent receptor  51.65 
 
 		 796 aa  738    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0041  putative TonB-dependent siderophore receptor  45.69 
 
 		 821 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4774  TonB-dependent receptor  36.77 
 
 		 760 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594782  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  33.5 
 
 		 794 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2999  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 778 aa  364  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  34.1 
 
 		 804 aa  364  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3037  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 778 aa  363  9e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000978239  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0477  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 778 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.642633  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1598  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 778 aa  362  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0220938  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2935  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 778 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0458457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0146  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 778 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1000  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 778 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2630  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 778 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 772 aa  353  7e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 772 aa  353  7e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4118  TonB-dependent receptor  34.67 
 
 		 788 aa  347  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00057818  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  32.54 
 
 		 779 aa  342  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 784 aa  340  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0532  hypothetical protein  33.33 
 
 		 790 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203812  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1010  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 790 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0114301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0970  TonB-dependent receptor  33.15 
 
 		 786 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108903  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 784 aa  334  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2388  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 788 aa  327  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 761 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2882  TonB-dependent receptor protein  28.37 
 
 		 780 aa  299  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00344491  hitchhiker  0.00617905 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0635  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 874 aa  277  4e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1629  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 718 aa  216  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00166049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 762 aa  160  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 719 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 742 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 737 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 742 aa  140  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 764 aa  137  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 736 aa  134  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0676  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 732 aa  87  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.218893  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 688 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  25.69 
 
 		 807 aa  73.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  21.4 
 
 		 828 aa  71.2  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  21.33 
 
 		 726 aa  71.2  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  21.93 
 
 		 613 aa  69.3  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 804 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 652 aa  67.4  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  21.18 
 
 		 815 aa  67.4  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4255  TonB-dependent receptor  22.01 
 
 		 720 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  21.6 
 
 		 666 aa  67  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  24.63 
 
 		 788 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3667  TonB-dependent receptor plug  25.24 
 
 		 624 aa  65.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 709 aa  65.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  23.2 
 
 		 652 aa  65.5  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 828 aa  64.3  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0993  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 735 aa  63.9  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0663099  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  24.79 
 
 		 620 aa  63.9  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  21.79 
 
 		 655 aa  63.9  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  21.99 
 
 		 702 aa  63.9  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 836 aa  63.9  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  22.83 
 
 		 696 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  22.83 
 
 		 696 aa  63.5  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1412  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 399 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 743 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  21.06 
 
 		 663 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 697 aa  62.4  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  24.62 
 
 		 775 aa  62  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.78 
 
 		 867 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  21.25 
 
 		 681 aa  61.6  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 799 aa  61.2  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 799 aa  60.8  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  28.7 
 
 		 698 aa  60.1  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 697 aa  60.5  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3189  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 728 aa  60.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  22.05 
 
 		 653 aa  60.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 777 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  21.79 
 
 		 695 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 777 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 777 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 775 aa  59.7  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3462  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 668 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.81 
 
 		 689 aa  59.7  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  24.15 
 
 		 732 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 709 aa  58.9  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 799 aa  58.9  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 653 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 662 aa  59.3  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  22.37 
 
 		 658 aa  58.9  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 662 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 662 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 680 aa  58.5  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 693 aa  58.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  20.65 
 
 		 698 aa  57.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  20.65 
 
 		 698 aa  57.8  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  20.65 
 
 		 698 aa  57.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 635 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  22.62 
 
 		 885 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 666 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  22.19 
 
 		 891 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3613  TonB-dependent receptor plug  23.3 
 
 		 664 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659898  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 742 aa  56.6  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 621 aa  56.6  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 653 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 873 aa  55.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>