More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4255 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4255  TonB-dependent receptor  100 
 
 
720 aa  1365    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1412  TonB-dependent receptor  58.25 
 
 
399 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2433  TonB-dependent receptor  32.7 
 
 
754 aa  306  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.747625 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2885  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 
673 aa  217  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.159782 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1273  TonB-dependent receptor  34.01 
 
 
665 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227492  normal  0.0101206 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5132  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 
682 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1375  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 
681 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1662  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 
686 aa  167  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.917445  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0772  TonB-dependent receptor plug  35.78 
 
 
800 aa  151  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0676  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 
732 aa  147  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.218893  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 
719 aa  117  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 
742 aa  112  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 
737 aa  102  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 
764 aa  101  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 
742 aa  101  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 
618 aa  99.4  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 
602 aa  96.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 
736 aa  95.9  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  25.42 
 
 
680 aa  95.1  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 
1128 aa  92  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 
788 aa  90.9  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  25.19 
 
 
614 aa  89.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 
777 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 
777 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 
777 aa  89  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.55 
 
 
631 aa  87.4  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 
626 aa  84.3  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  35.57 
 
 
615 aa  84  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  26.76 
 
 
779 aa  84  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 
740 aa  84  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 
626 aa  84  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 
613 aa  83.6  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  23.41 
 
 
686 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  25.6 
 
 
676 aa  82  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 
757 aa  82  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 
679 aa  82  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  21.16 
 
 
653 aa  81.3  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.15 
 
 
1023 aa  81.3  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1524  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 
605 aa  80.1  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 
641 aa  79.7  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 
762 aa  79.7  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.7 
 
 
631 aa  79  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 
634 aa  77.8  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  20.89 
 
 
655 aa  77.4  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  23.22 
 
 
634 aa  77.4  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 
743 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  24.06 
 
 
769 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  26.98 
 
 
794 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 
614 aa  76.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  34.09 
 
 
639 aa  75.1  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.57 
 
 
656 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  21.04 
 
 
665 aa  73.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 
763 aa  72.4  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  32.98 
 
 
688 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  22.98 
 
 
656 aa  72.4  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 
804 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 
634 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 
688 aa  71.2  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 
920 aa  70.1  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.33 
 
 
631 aa  70.1  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1260  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 
581 aa  70.1  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 
647 aa  69.7  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 
731 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  27.56 
 
 
646 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.35 
 
 
696 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 
619 aa  69.7  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.35 
 
 
696 aa  70.1  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 
701 aa  69.7  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.73 
 
 
614 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 
705 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1838  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 
796 aa  68.6  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  22.73 
 
 
638 aa  68.2  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 
734 aa  68.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  23.1 
 
 
641 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  23.1 
 
 
663 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  23.1 
 
 
663 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  23.1 
 
 
663 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  23.1 
 
 
663 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 
652 aa  67.8  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 
627 aa  67.8  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  23.04 
 
 
650 aa  67.4  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0041  putative TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 
821 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130227 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 
772 aa  67  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 
642 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 
642 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 
772 aa  67  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 
681 aa  67  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  23.23 
 
 
641 aa  66.2  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  24.71 
 
 
689 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  23.23 
 
 
650 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  23.23 
 
 
650 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 
642 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  22.01 
 
 
782 aa  66.6  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  28.86 
 
 
623 aa  66.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25.54 
 
 
695 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  23.23 
 
 
650 aa  65.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 
709 aa  65.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 
683 aa  65.9  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  21.94 
 
 
730 aa  65.9  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  22.62 
 
 
659 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>