More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1260 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1260  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 581 aa  1197    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1278  TonB-dependent receptor  37.41 
 
 		 571 aa  380  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.354768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1019  TonB-dependent receptor  36.09 
 
 		 572 aa  356  6.999999999999999e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.463707  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 		 634 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  24.84 
 
 		 661 aa  113  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 634 aa  113  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  25.47 
 
 		 623 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  23 
 
 		 671 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.98 
 
 		 653 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.02 
 
 		 630 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 641 aa  101  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  23.72 
 
 		 666 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  23.87 
 
 		 666 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  23.87 
 
 		 666 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  23.72 
 
 		 666 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  24.32 
 
 		 666 aa  99.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  23.92 
 
 		 656 aa  98.2  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4414  TonB-dependent receptor plug  24.45 
 
 		 639 aa  98.2  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3315  TonB-dependent receptor plug  23.25 
 
 		 650 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  25.24 
 
 		 663 aa  95.5  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.64 
 
 		 656 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  24.07 
 
 		 646 aa  95.9  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  23.57 
 
 		 650 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 648 aa  95.1  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  22.3 
 
 		 652 aa  93.6  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  23.26 
 
 		 650 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  23.41 
 
 		 650 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  23.41 
 
 		 650 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  23.15 
 
 		 636 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 702 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 618 aa  92  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  24.13 
 
 		 663 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  23.95 
 
 		 659 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 628 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  23.26 
 
 		 650 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  23.79 
 
 		 663 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  23.79 
 
 		 663 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 682 aa  90.9  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  23.79 
 
 		 663 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  23.79 
 
 		 663 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  23.79 
 
 		 663 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  23.79 
 
 		 641 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 693 aa  90.1  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  24.67 
 
 		 655 aa  90.5  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  22.28 
 
 		 665 aa  89.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  23.79 
 
 		 663 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  22.28 
 
 		 665 aa  89.4  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 657 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  22.28 
 
 		 665 aa  89.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  21.8 
 
 		 665 aa  87.8  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 667 aa  87.4  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 698 aa  87  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 698 aa  87  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1524  TonB-dependent receptor plug  25.32 
 
 		 605 aa  86.7  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 698 aa  87  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  24.88 
 
 		 613 aa  85.9  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  22.07 
 
 		 665 aa  85.1  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  21.5 
 
 		 681 aa  85.1  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 653 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 627 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 804 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3699  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 685 aa  84.3  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 710 aa  84  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  22.11 
 
 		 642 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 653 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 613 aa  82  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  23.71 
 
 		 676 aa  82  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  22.87 
 
 		 640 aa  81.3  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  23.15 
 
 		 652 aa  81.3  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  22.84 
 
 		 653 aa  81.3  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 635 aa  81.3  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  22.69 
 
 		 746 aa  80.9  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  24.16 
 
 		 627 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 602 aa  80.9  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 635 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 1128 aa  80.5  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  22.49 
 
 		 683 aa  80.5  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 666 aa  80.5  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  23.56 
 
 		 634 aa  79.7  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 707 aa  79.7  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 641 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 651 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  22.9 
 
 		 618 aa  78.2  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  22.79 
 
 		 620 aa  78.2  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  23.83 
 
 		 739 aa  78.2  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  24.9 
 
 		 807 aa  77.8  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4967  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 698 aa  77.4  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2063  TonB-dependent receptor  22.49 
 
 		 645 aa  77.4  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.785465  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  23.92 
 
 		 700 aa  77  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.03 
 
 		 616 aa  77  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  24.38 
 
 		 642 aa  77  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  22.49 
 
 		 680 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 658 aa  77  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  22.89 
 
 		 633 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  21.75 
 
 		 674 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 652 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4821  TonB-dependent receptor  22.49 
 
 		 621 aa  75.5  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0628  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  22.26 
 
 		 638 aa  75.1  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288278  normal  0.81106 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  22.4 
 
 		 714 aa  75.5  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3696  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 620 aa  75.5  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.405494  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>