More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2426 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 652 aa  1331    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  49.76 
 
 		 636 aa  592  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  47.9 
 
 		 593 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  40.77 
 
 		 650 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  39.54 
 
 		 627 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2389  TonB-dependent receptor plug  40.3 
 
 		 615 aa  429  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000607441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1830  TonB-dependent receptor plug  39.67 
 
 		 616 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2900  TonB-dependent receptor plug  41.99 
 
 		 609 aa  413  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  37.73 
 
 		 618 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1358  TonB-dependent receptor, plug  37.75 
 
 		 626 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00131062  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  35.08 
 
 		 621 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3117  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 		 619 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1178  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 		 621 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 618 aa  148  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 634 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  24.68 
 
 		 623 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 647 aa  141  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  26.49 
 
 		 646 aa  133  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 709 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  25.33 
 
 		 633 aa  131  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 642 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  25.51 
 
 		 639 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 613 aa  125  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3315  TonB-dependent receptor plug  24.67 
 
 		 650 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.48 
 
 		 631 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 705 aa  119  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.15 
 
 		 615 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 634 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 657 aa  115  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 602 aa  115  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  25.71 
 
 		 628 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 641 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 635 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 627 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 653 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 682 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  27.77 
 
 		 659 aa  111  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 641 aa  111  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  24.27 
 
 		 638 aa  110  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.85 
 
 		 623 aa  110  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 1128 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  26.01 
 
 		 623 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 694 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.54 
 
 		 630 aa  108  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  31.28 
 
 		 617 aa  108  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.54 
 
 		 630 aa  108  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.32 
 
 		 614 aa  108  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.32 
 
 		 614 aa  108  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 593 aa  107  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.33 
 
 		 614 aa  107  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.33 
 
 		 614 aa  107  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.89 
 
 		 615 aa  107  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  24.19 
 
 		 753 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 648 aa  106  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  25.21 
 
 		 620 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 649 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.71 
 
 		 614 aa  106  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  26.3 
 
 		 712 aa  105  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  35.63 
 
 		 614 aa  105  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  23.15 
 
 		 628 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  21.81 
 
 		 653 aa  104  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  35.62 
 
 		 631 aa  104  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  26.76 
 
 		 650 aa  104  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  27.09 
 
 		 655 aa  104  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.95 
 
 		 614 aa  104  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  32.42 
 
 		 613 aa  104  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 665 aa  104  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  26.04 
 
 		 663 aa  103  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 669 aa  103  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  25.88 
 
 		 659 aa  103  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  26.04 
 
 		 663 aa  103  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 670 aa  103  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  26.04 
 
 		 663 aa  103  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  26.58 
 
 		 650 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  26.58 
 
 		 650 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  24.73 
 
 		 671 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  23.92 
 
 		 640 aa  103  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  25.87 
 
 		 663 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 627 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  25.87 
 
 		 663 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  26.58 
 
 		 650 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 		 686 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  26.58 
 
 		 650 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4414  TonB-dependent receptor plug  22.79 
 
 		 639 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  26.48 
 
 		 693 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  35.5 
 
 		 618 aa  102  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 748 aa  102  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  25.87 
 
 		 663 aa  102  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.75 
 
 		 631 aa  101  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.75 
 
 		 631 aa  101  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 697 aa  100  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  40.32 
 
 		 614 aa  100  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  40.32 
 
 		 614 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  40.32 
 
 		 614 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1382  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 655 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00890122  normal  0.0713693 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 615 aa  99.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  40.32 
 
 		 614 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 621 aa  100  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  40.32 
 
 		 614 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  25.99 
 
 		 641 aa  100  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>