More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0883 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  100 
 
 		 627 aa  1273    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  53.87 
 
 		 650 aa  649    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  38.29 
 
 		 636 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  39.3 
 
 		 593 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2900  TonB-dependent receptor plug  41.91 
 
 		 609 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  42.24 
 
 		 618 aa  415  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2389  TonB-dependent receptor plug  39.83 
 
 		 615 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000607441  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  39.34 
 
 		 652 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1830  TonB-dependent receptor plug  39.74 
 
 		 616 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  40.16 
 
 		 621 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1358  TonB-dependent receptor, plug  38.83 
 
 		 626 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00131062  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3117  TonB-dependent receptor plug  34.32 
 
 		 619 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1178  TonB-dependent receptor plug  33.74 
 
 		 621 aa  296  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  35.22 
 
 		 617 aa  118  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  34.8 
 
 		 615 aa  112  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  26.8 
 
 		 623 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 593 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  24.17 
 
 		 639 aa  103  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  21.55 
 
 		 633 aa  101  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  34.29 
 
 		 614 aa  100  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  24.01 
 
 		 646 aa  97.8  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  22.89 
 
 		 634 aa  97.1  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.46 
 
 		 728 aa  96.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 669 aa  95.5  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  25.12 
 
 		 746 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 626 aa  95.9  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  23.98 
 
 		 744 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 626 aa  95.5  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 657 aa  94.7  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 665 aa  94.7  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  32.46 
 
 		 653 aa  94  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 643 aa  93.2  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  23.8 
 
 		 744 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 		 637 aa  92.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 		 653 aa  92  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 		 653 aa  92  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  23.68 
 
 		 634 aa  90.9  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 		 653 aa  90.9  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 648 aa  90.9  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  31.28 
 
 		 653 aa  90.9  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 614 aa  90.5  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 707 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  35.06 
 
 		 710 aa  89.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.71 
 
 		 653 aa  89  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 682 aa  89  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 642 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  23.61 
 
 		 744 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 698 aa  88.6  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 624 aa  88.6  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 694 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 653 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 617 aa  88.2  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 602 aa  87.8  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 659 aa  87.4  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 642 aa  87.4  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 642 aa  87.4  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  25.87 
 
 		 759 aa  87  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 638 aa  87  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 735 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 613 aa  87  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 653 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0628  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  30.46 
 
 		 638 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288278  normal  0.81106 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 665 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 652 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  29.35 
 
 		 1023 aa  85.1  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 679 aa  85.1  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 653 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 634 aa  84.7  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 618 aa  84.7  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  29.17 
 
 		 613 aa  84.7  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 714 aa  84  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 613 aa  84.3  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.77 
 
 		 688 aa  84  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.91 
 
 		 619 aa  84  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 621 aa  83.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 705 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 619 aa  82.8  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  24.56 
 
 		 746 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 649 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  24.41 
 
 		 620 aa  81.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 673 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  31.6 
 
 		 759 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 709 aa  81.3  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 697 aa  81.3  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 688 aa  81.3  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 597 aa  81.3  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 612 aa  80.9  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  28.25 
 
 		 659 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 634 aa  80.9  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  24.19 
 
 		 671 aa  80.9  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.6 
 
 		 631 aa  80.5  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 624 aa  80.5  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 632 aa  80.5  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4967  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 698 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.48 
 
 		 862 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 642 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  31.6 
 
 		 862 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  33.33 
 
 		 665 aa  79.7  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  30.65 
 
 		 661 aa  79.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 737 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>