More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1473 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 669 aa  1377    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  42.84 
 
 		 651 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  36.5 
 
 		 665 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  29.29 
 
 		 677 aa  295  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4088  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 650 aa  279  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0094  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 649 aa  274  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 699 aa  225  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.72 
 
 		 653 aa  195  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0131  TonB-dependent receptor  35.57 
 
 		 695 aa  190  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 654 aa  188  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 678 aa  182  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  30.29 
 
 		 741 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3867  TonB-dependent receptor, plug  30.29 
 
 		 729 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0089  TonB-dependent receptor, plug  30.46 
 
 		 707 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4450  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 767 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4310  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 737 aa  173  9e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4255  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 749 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3676  TonB-dependent receptor, plug  32.31 
 
 		 735 aa  171  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 634 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.01 
 
 		 675 aa  148  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0604  TonB-dependent outer membrane receptor  23.9 
 
 		 682 aa  147  8.000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 668 aa  145  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  26.53 
 
 		 646 aa  145  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 657 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3699  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 685 aa  143  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 731 aa  140  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 731 aa  140  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 674 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  25.84 
 
 		 623 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1516  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 690 aa  126  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 708 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 675 aa  124  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  25.74 
 
 		 636 aa  124  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 683 aa  124  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 635 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 686 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 667 aa  118  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  25.14 
 
 		 639 aa  118  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  25.82 
 
 		 653 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 635 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 697 aa  114  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 653 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  34.17 
 
 		 634 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 716 aa  112  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 656 aa  112  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 744 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 627 aa  109  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3667  TonB-dependent receptor plug  24.47 
 
 		 624 aa  104  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 663 aa  104  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1228  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 623 aa  104  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0002097  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 618 aa  100  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  24.72 
 
 		 655 aa  100  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1952  TonB-dependent receptor  21.02 
 
 		 656 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446334  normal  0.0364758 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  24.9 
 
 		 665 aa  99  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1983  TonB-dependent receptor  20.72 
 
 		 727 aa  98.2  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  23.61 
 
 		 647 aa  95.9  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  24.61 
 
 		 666 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  25.21 
 
 		 627 aa  95.1  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  24.61 
 
 		 666 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.28 
 
 		 631 aa  95.1  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0385  TonB-dependent receptor, plug  23.22 
 
 		 713 aa  95.1  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  24.18 
 
 		 652 aa  94.7  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  24.61 
 
 		 666 aa  94.4  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 709 aa  94  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 652 aa  93.2  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 693 aa  93.6  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2970  TonB-dependent receptor  21.24 
 
 		 718 aa  93.6  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222916  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  24.47 
 
 		 666 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  38.96 
 
 		 710 aa  92.8  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2482  TonB-dependent receptor  20.94 
 
 		 728 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 640 aa  92.4  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 634 aa  92  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 762 aa  91.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  25.3 
 
 		 668 aa  91.3  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.03 
 
 		 647 aa  90.9  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1382  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 655 aa  90.9  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00890122  normal  0.0713693 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25.65 
 
 		 695 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 701 aa  90.1  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  27.01 
 
 		 671 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 698 aa  89.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 641 aa  89.4  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 705 aa  88.2  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  31.47 
 
 		 613 aa  87.8  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  24.38 
 
 		 656 aa  87.8  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25.11 
 
 		 696 aa  87  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25.11 
 
 		 696 aa  87  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  34.86 
 
 		 640 aa  87  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  29.76 
 
 		 633 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  24.82 
 
 		 659 aa  87  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  34.59 
 
 		 746 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  34.59 
 
 		 746 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  34.59 
 
 		 746 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 627 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 707 aa  86.3  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  23.59 
 
 		 696 aa  85.9  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  34.59 
 
 		 746 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  34.59 
 
 		 746 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  34.59 
 
 		 746 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 680 aa  85.5  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  34.59 
 
 		 746 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>