More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3576 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  91.42 
 
 		 653 aa  1245    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  92.5 
 
 		 652 aa  1229    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  91.88 
 
 		 653 aa  1238    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  95.71 
 
 		 653 aa  1244    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  69.05 
 
 		 665 aa  934    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  97.55 
 
 		 653 aa  1272    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 653 aa  1338    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  57.38 
 
 		 656 aa  769    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  66.57 
 
 		 656 aa  889    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  90.81 
 
 		 653 aa  1209    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  90.66 
 
 		 653 aa  1210    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  61.48 
 
 		 659 aa  795    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  56.52 
 
 		 646 aa  721    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  90.96 
 
 		 653 aa  1220    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  26.92 
 
 		 713 aa  210  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4390  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 704 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 704 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 688 aa  171  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  29.4 
 
 		 666 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 657 aa  156  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 644 aa  147  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  24.3 
 
 		 706 aa  143  9e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 638 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 656 aa  118  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  38.8 
 
 		 618 aa  108  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  23.57 
 
 		 664 aa  107  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  24.3 
 
 		 776 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  22.09 
 
 		 720 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  22.09 
 
 		 720 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  22.09 
 
 		 720 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  22.09 
 
 		 720 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 700 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  26.95 
 
 		 812 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 700 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 700 aa  102  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 720 aa  101  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.8 
 
 		 728 aa  100  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  24.23 
 
 		 712 aa  100  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 700 aa  100  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  30.57 
 
 		 618 aa  100  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  23.39 
 
 		 690 aa  100  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 700 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  23.99 
 
 		 825 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  27.95 
 
 		 650 aa  98.6  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  37.31 
 
 		 681 aa  98.6  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 678 aa  99  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  24.06 
 
 		 710 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  21.11 
 
 		 748 aa  97.1  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  21.11 
 
 		 748 aa  97.1  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  23.83 
 
 		 825 aa  97.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  35.98 
 
 		 619 aa  96.3  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 700 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 621 aa  96.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 700 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 715 aa  96.3  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 641 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  23.34 
 
 		 815 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  22.01 
 
 		 714 aa  95.1  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 621 aa  95.5  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1786  TonB-dependent heme receptor  22.17 
 
 		 718 aa  94.7  5e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 729 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  22.5 
 
 		 731 aa  94.4  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  25.5 
 
 		 628 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  21.29 
 
 		 724 aa  94.4  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  21.96 
 
 		 715 aa  94.4  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  23.55 
 
 		 703 aa  94  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  24.46 
 
 		 710 aa  94  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  29.91 
 
 		 614 aa  94  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  22.81 
 
 		 700 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  22.81 
 
 		 700 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 789 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0118  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 633 aa  92.4  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  22.3 
 
 		 694 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 648 aa  92.4  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  28.43 
 
 		 731 aa  91.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 		 715 aa  91.3  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 675 aa  91.3  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02129  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 667 aa  90.9  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  23.47 
 
 		 636 aa  90.9  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  41.48 
 
 		 751 aa  90.9  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 619 aa  90.5  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  21.45 
 
 		 749 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  23.83 
 
 		 689 aa  89.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  21.26 
 
 		 720 aa  90.1  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  22.41 
 
 		 795 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  24.07 
 
 		 664 aa  90.1  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 634 aa  89.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  21.59 
 
 		 707 aa  89.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  21.74 
 
 		 723 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  33.51 
 
 		 602 aa  88.6  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  21.18 
 
 		 724 aa  88.6  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  23.38 
 
 		 817 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  23.4 
 
 		 712 aa  89  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 694 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  31.02 
 
 		 627 aa  88.2  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2389  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 615 aa  88.2  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000607441  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  22.07 
 
 		 711 aa  88.2  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  22.8 
 
 		 707 aa  87.4  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 701 aa  87.4  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 679 aa  87.4  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>