More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0635 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 706 aa  1415    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  28.16 
 
 		 713 aa  210  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 688 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  24.76 
 
 		 653 aa  145  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 665 aa  145  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  25.29 
 
 		 656 aa  144  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 653 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 653 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.62 
 
 		 653 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 653 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 652 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 		 653 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 657 aa  139  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  24.48 
 
 		 653 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  24.34 
 
 		 653 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.19 
 
 		 646 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 656 aa  129  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  24.64 
 
 		 659 aa  124  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 656 aa  108  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1601  TonB-dependent heme receptor  23.23 
 
 		 702 aa  107  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  23.35 
 
 		 690 aa  99.8  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  36.02 
 
 		 704 aa  97.4  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  35.03 
 
 		 624 aa  96.7  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1786  TonB-dependent heme receptor  23.27 
 
 		 718 aa  96.3  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  28.87 
 
 		 666 aa  96.3  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  23.6 
 
 		 664 aa  95.5  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  32.95 
 
 		 618 aa  94.7  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  33.68 
 
 		 613 aa  94.4  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 644 aa  94  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  31.71 
 
 		 614 aa  94  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  35.93 
 
 		 663 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  35.93 
 
 		 663 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  35.93 
 
 		 663 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  35.93 
 
 		 663 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  35.93 
 
 		 659 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  35.93 
 
 		 663 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  24.03 
 
 		 728 aa  92  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  35.93 
 
 		 663 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  39.13 
 
 		 641 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  36.49 
 
 		 650 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  36.49 
 
 		 650 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  35.26 
 
 		 656 aa  90.5  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  36.49 
 
 		 650 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  32.28 
 
 		 611 aa  89.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  37.24 
 
 		 650 aa  89.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 715 aa  89.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  36.49 
 
 		 650 aa  89.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  30.35 
 
 		 1023 aa  89  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 697 aa  88.2  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  22.4 
 
 		 701 aa  87.8  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 670 aa  87.8  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  34.18 
 
 		 639 aa  87.8  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  29.36 
 
 		 661 aa  86.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 619 aa  87  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  36.99 
 
 		 664 aa  86.7  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 736 aa  87  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 611 aa  87  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 706 aa  86.3  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  35.67 
 
 		 617 aa  86.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  33.33 
 
 		 704 aa  86.3  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  34.39 
 
 		 681 aa  84.3  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  31.03 
 
 		 740 aa  84  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 701 aa  84  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  33.96 
 
 		 631 aa  83.2  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  36.67 
 
 		 593 aa  84  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.37 
 
 		 706 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.23 
 
 		 706 aa  83.2  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.1 
 
 		 726 aa  83.2  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.23 
 
 		 706 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.23 
 
 		 721 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.23 
 
 		 706 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 638 aa  82.4  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  32.18 
 
 		 647 aa  82  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  35.44 
 
 		 1128 aa  82.4  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 806 aa  82  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  35.37 
 
 		 615 aa  81.6  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  36 
 
 		 637 aa  81.6  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  34 
 
 		 714 aa  81.3  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  31.14 
 
 		 732 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.16 
 
 		 656 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  33.15 
 
 		 651 aa  81.3  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1064  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 		 661 aa  81.3  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00188221  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  34.34 
 
 		 726 aa  81.3  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  31.68 
 
 		 759 aa  80.9  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 649 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 629 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  35.5 
 
 		 615 aa  80.1  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  32.93 
 
 		 746 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2213  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 		 621 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1001  TonB-dependent receptor  36.91 
 
 		 628 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.11298  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1977  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA 2 (Sulfate-transporting ATPase 2)  32.34 
 
 		 326 aa  79.3  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 678 aa  79.7  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 624 aa  79.7  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  32.22 
 
 		 751 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  32.22 
 
 		 751 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  32.22 
 
 		 751 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 634 aa  79  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  30.11 
 
 		 623 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  36.88 
 
 		 613 aa  79  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 678 aa  79  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>