More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0628 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 688 aa  1402    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  33.87 
 
 		 704 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4390  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 		 704 aa  287  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  31.38 
 
 		 713 aa  271  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  32.39 
 
 		 666 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 644 aa  246  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 657 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 638 aa  228  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 665 aa  187  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  25.81 
 
 		 706 aa  184  7e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 653 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 653 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 652 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 		 653 aa  173  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 653 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 653 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 653 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 		 653 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  28.1 
 
 		 653 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  26.7 
 
 		 659 aa  162  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 656 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  26.42 
 
 		 656 aa  156  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  26.52 
 
 		 646 aa  135  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  25.04 
 
 		 640 aa  133  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 675 aa  126  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 801 aa  125  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 777 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 777 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 777 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  24.49 
 
 		 788 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  23.2 
 
 		 664 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 679 aa  114  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 602 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  24.65 
 
 		 767 aa  112  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  25.74 
 
 		 691 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  24.86 
 
 		 715 aa  111  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.97 
 
 		 706 aa  111  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  24.45 
 
 		 664 aa  111  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  25.24 
 
 		 719 aa  110  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 700 aa  110  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 		 675 aa  109  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.62 
 
 		 706 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  24.5 
 
 		 727 aa  108  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  25.34 
 
 		 774 aa  108  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 705 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 726 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.69 
 
 		 706 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 		 774 aa  107  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  25.19 
 
 		 774 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.59 
 
 		 721 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  25.19 
 
 		 774 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 698 aa  105  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 613 aa  105  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 688 aa  105  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.34 
 
 		 706 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.54 
 
 		 728 aa  104  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 		 774 aa  104  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  25.36 
 
 		 618 aa  104  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  23.59 
 
 		 707 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  23.91 
 
 		 817 aa  103  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.09 
 
 		 666 aa  102  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  24.68 
 
 		 689 aa  102  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 721 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  23.01 
 
 		 716 aa  101  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 619 aa  101  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  22.83 
 
 		 666 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  25.37 
 
 		 623 aa  100  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  22.83 
 
 		 666 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  24.12 
 
 		 646 aa  100  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  31.7 
 
 		 686 aa  100  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 721 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  23.33 
 
 		 726 aa  99.4  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  23.71 
 
 		 653 aa  99.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 713 aa  99.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  22.98 
 
 		 666 aa  98.6  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 		 733 aa  99  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  23.73 
 
 		 702 aa  98.6  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  23.73 
 
 		 702 aa  98.6  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  23.29 
 
 		 694 aa  98.2  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 705 aa  98.2  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  24.23 
 
 		 796 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 678 aa  97.8  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 700 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 701 aa  97.8  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  22.54 
 
 		 666 aa  97.4  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 681 aa  95.9  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  24.4 
 
 		 706 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  24.4 
 
 		 706 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  40.6 
 
 		 647 aa  96.3  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  24.58 
 
 		 695 aa  95.5  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  23.05 
 
 		 693 aa  95.5  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  21.33 
 
 		 698 aa  95.1  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  24.48 
 
 		 634 aa  95.5  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  22.27 
 
 		 655 aa  95.1  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  25.21 
 
 		 700 aa  94.7  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 705 aa  94.7  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 696 aa  94.7  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  37.97 
 
 		 639 aa  94.4  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  35.5 
 
 		 715 aa  94.4  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.46 
 
 		 1023 aa  94  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>