More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2309 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  56.69 
 
 
657 aa  740    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  58.32 
 
 
644 aa  725    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  100 
 
 
666 aa  1335    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  51.77 
 
 
638 aa  618  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 
688 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  30.41 
 
 
713 aa  223  8e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4390  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 
704 aa  203  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 
704 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  31.35 
 
 
656 aa  170  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 
653 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 
652 aa  165  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 
653 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  29.4 
 
 
653 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 
653 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 
653 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 
653 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 
653 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  29.23 
 
 
653 aa  162  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 
665 aa  153  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  29.68 
 
 
646 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  29.1 
 
 
659 aa  146  9e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 
656 aa  134  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  24.33 
 
 
708 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  23.78 
 
 
690 aa  117  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  25.16 
 
 
656 aa  111  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 
675 aa  105  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 
675 aa  103  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  23.82 
 
 
664 aa  102  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 
683 aa  100  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 
692 aa  100  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  23.9 
 
 
723 aa  99.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 
742 aa  97.1  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  25.86 
 
 
693 aa  96.3  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  33.5 
 
 
706 aa  95.9  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  26.19 
 
 
638 aa  95.5  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 
628 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  24.49 
 
 
653 aa  94.7  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 
627 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  32.53 
 
 
686 aa  94  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1601  TonB-dependent heme receptor  22.84 
 
 
702 aa  94  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 
712 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 
637 aa  92.8  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  24.15 
 
 
749 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  24.57 
 
 
696 aa  91.3  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.53 
 
 
619 aa  90.9  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  22.63 
 
 
664 aa  90.5  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 
705 aa  89.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  24.86 
 
 
618 aa  88.6  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  23.88 
 
 
656 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  23.74 
 
 
720 aa  88.6  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  24.03 
 
 
680 aa  87.4  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  25.1 
 
 
614 aa  87  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 
614 aa  87  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.18 
 
 
685 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  22.58 
 
 
731 aa  85.5  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.18 
 
 
685 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.18 
 
 
685 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.37 
 
 
685 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.18 
 
 
685 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1786  TonB-dependent heme receptor  22.7 
 
 
718 aa  84.7  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  24.37 
 
 
821 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  23.09 
 
 
689 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 
647 aa  83.6  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  23.98 
 
 
685 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 
705 aa  83.2  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 
624 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.28 
 
 
712 aa  82.8  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 
731 aa  82.4  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 
678 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  22.88 
 
 
722 aa  82.4  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  30.96 
 
 
680 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 
688 aa  81.6  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
701 aa  80.1  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 
701 aa  80.1  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  23.37 
 
 
850 aa  80.5  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  24.53 
 
 
646 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2213  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 
621 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604823  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  22.78 
 
 
699 aa  80.5  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  25.75 
 
 
623 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  22.24 
 
 
776 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  22.77 
 
 
711 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 
714 aa  79.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  24.63 
 
 
708 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0221  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.99 
 
 
755 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 
678 aa  79.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  23.78 
 
 
641 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 
737 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  24.24 
 
 
821 aa  78.2  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0118  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 
633 aa  78.2  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  22.79 
 
 
767 aa  77.8  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 
679 aa  78.2  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  23.69 
 
 
729 aa  78.2  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  22.57 
 
 
784 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  23.26 
 
 
729 aa  77.4  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 
680 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 
697 aa  77.4  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 
613 aa  76.6  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 
700 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  23.15 
 
 
809 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  22.73 
 
 
784 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>