More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2631 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  57.73 
 
 		 656 aa  749    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  57.75 
 
 		 653 aa  762    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  56.36 
 
 		 653 aa  723    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  56.84 
 
 		 653 aa  728    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  59.78 
 
 		 665 aa  781    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  54.93 
 
 		 656 aa  717    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  57.42 
 
 		 653 aa  754    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  57.73 
 
 		 653 aa  760    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  56.38 
 
 		 653 aa  724    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  52.57 
 
 		 659 aa  675    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  56.69 
 
 		 653 aa  750    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  57.42 
 
 		 653 aa  755    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  56.67 
 
 		 652 aa  741    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  100 
 
 		 646 aa  1307    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  28.66 
 
 		 713 aa  213  7e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 704 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4390  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 704 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 657 aa  170  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  29.68 
 
 		 666 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 644 aa  151  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 688 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 638 aa  143  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  24.19 
 
 		 706 aa  134  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 664 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  23.3 
 
 		 738 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0118  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 633 aa  117  8.999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  24.54 
 
 		 690 aa  115  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  22.69 
 
 		 742 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  23.62 
 
 		 729 aa  110  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  23.48 
 
 		 729 aa  110  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  22.62 
 
 		 748 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  22.62 
 
 		 748 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1601  TonB-dependent heme receptor  24.51 
 
 		 702 aa  106  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  22.36 
 
 		 737 aa  105  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 656 aa  105  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  23.19 
 
 		 703 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 688 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  23.19 
 
 		 703 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1786  TonB-dependent heme receptor  22.94 
 
 		 718 aa  102  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  24.25 
 
 		 712 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  24.08 
 
 		 640 aa  101  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  23.04 
 
 		 729 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 632 aa  100  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 700 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 700 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 700 aa  96.3  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 700 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 695 aa  96.3  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.63 
 
 		 696 aa  95.5  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 701 aa  95.9  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 700 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.82 
 
 		 696 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  22.57 
 
 		 747 aa  94.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 728 aa  94.4  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 656 aa  94  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 700 aa  94  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 700 aa  94  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  22.57 
 
 		 747 aa  94  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4786  TonB-dependent siderophore receptor  23.1 
 
 		 712 aa  94  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.789588  normal  0.608467 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  23.95 
 
 		 749 aa  93.6  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  34.71 
 
 		 618 aa  93.2  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  24.12 
 
 		 664 aa  93.2  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  23.18 
 
 		 825 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.09 
 
 		 700 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.09 
 
 		 700 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  24.78 
 
 		 708 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  29.78 
 
 		 611 aa  90.9  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  24.19 
 
 		 711 aa  90.5  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  23.29 
 
 		 825 aa  90.5  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  24.17 
 
 		 690 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  22.69 
 
 		 799 aa  90.1  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 703 aa  89.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  21.19 
 
 		 812 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.12 
 
 		 721 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0628  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  25.54 
 
 		 638 aa  89  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288278  normal  0.81106 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 675 aa  89.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  35 
 
 		 614 aa  89  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  23.72 
 
 		 778 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.31 
 
 		 706 aa  88.6  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.47 
 
 		 706 aa  88.6  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  21.05 
 
 		 724 aa  88.2  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1524  TonB-dependent receptor plug  25.55 
 
 		 605 aa  88.2  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.33 
 
 		 706 aa  87.4  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  21.23 
 
 		 724 aa  87.4  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  36.71 
 
 		 639 aa  87.4  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.65 
 
 		 706 aa  87.4  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 791 aa  87  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  35.5 
 
 		 710 aa  87  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  36.99 
 
 		 646 aa  87  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  32.84 
 
 		 611 aa  86.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  23.76 
 
 		 731 aa  86.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.54 
 
 		 630 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  22.19 
 
 		 704 aa  86.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  35.9 
 
 		 619 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.54 
 
 		 630 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  23.39 
 
 		 776 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  21.47 
 
 		 715 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  38.06 
 
 		 751 aa  85.1  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  34.9 
 
 		 678 aa  85.5  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  21.88 
 
 		 747 aa  84.7  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>