Gene Sdel_1574 details

Gene Information       Plasmid Coverage information       Fosmid Coverage information       Sequence       

Gene Information

Locus tagSdel_1574 
Symbol 
ID8593114 
TypeCDS 
Is gene splicedNo 
Is pseudo geneNo 
Organism nameSulfurospirillum deleyianum DSM 6946 
KingdomBacteria 
Replicon accessionNC_013512 
Strand
Start bp1589352 
End bp1591439 
Gene Length2088 bp 
Protein Length695 aa 
Translation table11 
GC content41% 
IMG OID 
ProductTonB-dependent receptor 
Protein accessionYP_003304625 
Protein GI268680194 
COG category 
COG ID 
TIGRFAM ID 


Plasmid Coverage information

Num covering plasmid clones
Plasmid unclonability p-value0.000000898905 
Plasmid hitchhikingNo 
Plasmid clonabilityunclonable 
 

Fosmid Coverage information

Num covering fosmid clonesn/a 
Fosmid unclonability p-valuen/a 
Fosmid Hitchhikern/a 
Fosmid clonabilityn/a 
 

Sequence

Gene sequence
GTGAATAAAA AGGTTTTGGT ATTTGCCATG ATTTCAGTCG TTACCAGTGG GTTTCTTTAT 
GGCATGGATG AAACGTATAG CCTTGAGAGT GTCACGGTGA ATGCGAACAA GATAGAGGAA
AATATCCAAG ACGTTCCCCA AAGCATCACG GTCATTGATG AGGAAGTTTT GCATGAAAAA
GGGATAAAAA CTGTAACAGA TGCGATGAGA GAAGTGCCTA ATATGAATGT CAGTAGTACT
GCCAATGGTG CTACGATTTC ATTTAGAGGA CTCAATACTT CTATGTTTAC CAATAACAAT
CCTGTGGTGA TTTATGTCGA TGGTGTGCCT TATTATGACC GTTATGACTT TGATCCTTCT
TTGGCAGATG TAGCGCAAAT TGAGGTGTTA CGAGGACCTC AGGGAACCCT TTATGGTAAA
GATGCGGTGG GTGCGGTTGT GAATATCATC ACCAAAAAAC CAAGCAATGA ATGGCATGGA
AATGTGGGGG CTGAGTATGG CAATTACAAT GCCTTGAATA CCACATTTAA TACCAGTGGT
CCCTTGATAG AAGATAAGCT TTATGCAGGA ATAAATGGCT CTTTTAAGAA AGATGATGGC
TGGATTACCA ACGATTATCC AGGGATGGAT TCGGATGCCA ATCAAAAGCG TGATAGAAAA
AACAGTGGCT TTTTACTCTT CAAACCCACC GAGCGTTTTT CTGGAAAAGT AACCCTTAGC
GATAACTACA CCAAGCATTA TTTTATGAAT GGTTTTGTAA CAGACTCCAC AGGAATCCTC
TTGGGACTCG ATAGAGACGA TGGTAATCAC ATTAGTTCTG ATATGCCAAC GGTTGAGAGA
ACGGCAGTCA AAGCGCAAAG TCTCAATCTT GCTTATGAAT TTGATGCCTT TAAAGTTGAA
TCCACGACTA CCCATAAAAC ACTAGATTTA GAAGGTGATT TTGATGCGGA CTTTCAAGCC
AATAATAGCT CTGATGGGTT AAAACAGTTC AATTACACCG AGATTGAAAC ATGGACAGAA
GAGCTTAAAT TCTCAGGTCA AAATGATGCT TTTAAATGGG TAAGTGGTGT GTATGGGGAC
AAAGAAAAAC GAGAACAAGG ACCGTATGGA GCACAAGTCA TGTCAGGTGG TGCGGTATAC
GATGCCAATG CGGATTCTAC GACCGATAGC CAAACACAAG CATTGTTTGG ACAAGTGATG
ATTCCTTTTT GGGAGAAGTT TGAATTAACC CTAGGTGGAC GTTATCAGCG CATTAAAAAA
GAGATTGATT TAGTGACCAC ACAAACATGG GGTGGTATGG CATTTCCTGA TTATACTTTT
GAGGGTGAAA AAACATGGAA TGCTTTTATC CCTAAAATAG CACTCTCTTA TAAAGTCAAT
GATGCGCTCA GTACCTATGC TTCCATTGCC AAAGGATATA TGCCTGGTGG TTTTAACTAT
TTTGCAACGA GCGGTGGCAT GGAAGAAAAT AGCTTTGATC CTCAAACTTC CATTAACTAC
GAAGTAGGGG CGAAATACGT GGGGGAAAAT TATCTGCTTA ACGCCTCTGT CTTTCGTATG
AACATTGAAG ATATTCATAT CTATAAAATC GCTGGCGGTG GTATGGTCTG GCTCACTGAT
AATGCAAAAA AAGCGCATTC TCAGGGCATT GAGTTAGAGG GAAAATACTT TCTAAACCAA
AATATCGAAC TCTCAGGCGC ACTAGGGTTG ATTGAAGCCA AGTACGATGA TTACGATGCG
GGGAGTAGAA CCTATGATGG AGAGCGCATT GAAAATACAC CTCGCTACAC TGCTAATTTA
GGGATTGCGT ATGTGGCGAC TGCTGGATGG TATGGACGCG TGGATGTGAA TGCGATTGGC
TCAACAAGCT ATTACGATGG TGCCAATAGC CAGATGATTC GCTCCGATGG TGTGATTACC
TCCAATGCAA AGCTGGGGTA TAAATATAAA GCGTGGGATA TTTACAGCTT TATTACCAAT
ATTACCGATG AGTCATACAT CTCAAGTTAC CAATCCAAAA CAGGCTTAGC CATGGTTGGA
TTTAATGATC CTAGACGCTA TGGGGTTGGC TTTCGTTATA CATTTTAA
 
Protein sequence
MNKKVLVFAM ISVVTSGFLY GMDETYSLES VTVNANKIEE NIQDVPQSIT VIDEEVLHEK 
GIKTVTDAMR EVPNMNVSST ANGATISFRG LNTSMFTNNN PVVIYVDGVP YYDRYDFDPS
LADVAQIEVL RGPQGTLYGK DAVGAVVNII TKKPSNEWHG NVGAEYGNYN ALNTTFNTSG
PLIEDKLYAG INGSFKKDDG WITNDYPGMD SDANQKRDRK NSGFLLFKPT ERFSGKVTLS
DNYTKHYFMN GFVTDSTGIL LGLDRDDGNH ISSDMPTVER TAVKAQSLNL AYEFDAFKVE
STTTHKTLDL EGDFDADFQA NNSSDGLKQF NYTEIETWTE ELKFSGQNDA FKWVSGVYGD
KEKREQGPYG AQVMSGGAVY DANADSTTDS QTQALFGQVM IPFWEKFELT LGGRYQRIKK
EIDLVTTQTW GGMAFPDYTF EGEKTWNAFI PKIALSYKVN DALSTYASIA KGYMPGGFNY
FATSGGMEEN SFDPQTSINY EVGAKYVGEN YLLNASVFRM NIEDIHIYKI AGGGMVWLTD
NAKKAHSQGI ELEGKYFLNQ NIELSGALGL IEAKYDDYDA GSRTYDGERI ENTPRYTANL
GIAYVATAGW YGRVDVNAIG STSYYDGANS QMIRSDGVIT SNAKLGYKYK AWDIYSFITN
ITDESYISSY QSKTGLAMVG FNDPRRYGVG FRYTF