More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1574 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 695 aa  1424    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  30.69 
 
 		 715 aa  275  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 687 aa  243  7e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 720 aa  230  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 666 aa  224  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 851 aa  223  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 853 aa  219  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 695 aa  219  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 753 aa  217  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 783 aa  204  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 732 aa  201  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 710 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 713 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 685 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 720 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 751 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  26.63 
 
 		 751 aa  194  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 641 aa  187  6e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 724 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 732 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 733 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 794 aa  185  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 736 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 680 aa  182  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 729 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 670 aa  181  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 758 aa  180  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 702 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.01 
 
 		 685 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  26.26 
 
 		 739 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 703 aa  178  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 700 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 759 aa  177  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 704 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 784 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 713 aa  175  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 764 aa  174  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 730 aa  173  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 767 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 758 aa  172  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 749 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 794 aa  169  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 690 aa  167  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 762 aa  166  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 744 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  25.03 
 
 		 729 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 728 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 762 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 750 aa  164  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 792 aa  164  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 734 aa  163  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 775 aa  163  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 710 aa  162  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 747 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 765 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 769 aa  162  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 802 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 690 aa  162  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 763 aa  161  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0667  putative TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 793 aa  161  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 758 aa  161  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 759 aa  160  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 771 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 752 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 730 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 766 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 718 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 733 aa  159  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 776 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 741 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 758 aa  158  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 761 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 758 aa  157  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 741 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 697 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  25.26 
 
 		 691 aa  157  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 780 aa  157  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 763 aa  157  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 743 aa  157  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 773 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 732 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 737 aa  155  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 790 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 733 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.71 
 
 		 755 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 694 aa  154  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 712 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 748 aa  154  8e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2161  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 729 aa  153  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1436  TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 669 aa  153  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 711 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 736 aa  153  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  24.66 
 
 		 785 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 743 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 726 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 726 aa  152  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 730 aa  151  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 757 aa  152  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 712 aa  152  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10200  putative TonB-dependent receptor protein  24.89 
 
 		 694 aa  152  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.965249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>