More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0709 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  58.2 
 
 		 790 aa  922    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 790 aa  1607    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  62.25 
 
 		 792 aa  997    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  37.99 
 
 		 803 aa  496  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  37.94 
 
 		 832 aa  491  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  37.24 
 
 		 755 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  35.76 
 
 		 761 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  35.35 
 
 		 807 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  34.23 
 
 		 780 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  32.01 
 
 		 860 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 		 867 aa  383  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  35.48 
 
 		 780 aa  382  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 765 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 851 aa  355  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 761 aa  350  5e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 776 aa  325  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 704 aa  312  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 741 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 720 aa  295  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 856 aa  295  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 		 743 aa  292  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 753 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 794 aa  288  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 796 aa  288  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 784 aa  288  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 729 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 730 aa  283  7.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  34.04 
 
 		 771 aa  282  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 732 aa  282  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 749 aa  281  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 728 aa  281  5e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 771 aa  281  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 787 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  34.53 
 
 		 775 aa  276  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 736 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 745 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 783 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 774 aa  272  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 786 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 758 aa  270  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 		 804 aa  270  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 710 aa  270  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 730 aa  268  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 758 aa  265  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 758 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 758 aa  262  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  30.02 
 
 		 741 aa  261  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  31.33 
 
 		 754 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.94 
 
 		 739 aa  261  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 780 aa  260  7e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 758 aa  260  8e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 759 aa  259  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 750 aa  256  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 728 aa  254  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 784 aa  254  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 785 aa  251  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 734 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 730 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 758 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 770 aa  247  6e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 763 aa  246  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 825 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 743 aa  244  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 809 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 722 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 771 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 751 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 792 aa  238  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 743 aa  237  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 817 aa  237  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 747 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 808 aa  234  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 723 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 779 aa  234  6e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  29.94 
 
 		 759 aa  233  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 733 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 		 755 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 731 aa  231  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  27.06 
 
 		 751 aa  230  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 773 aa  228  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 733 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 762 aa  228  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 777 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 737 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 735 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 761 aa  224  7e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 790 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 771 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 786 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 771 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 757 aa  221  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 809 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 808 aa  220  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 859 aa  220  7e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 769 aa  220  7e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 724 aa  220  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 741 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 824 aa  219  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 726 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 783 aa  219  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>