More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1828 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  74.6 
 
 		 733 aa  1056    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  73.01 
 
 		 744 aa  1078    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  78.07 
 
 		 736 aa  1167    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 712 aa  1456    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  63.56 
 
 		 744 aa  950    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  73.4 
 
 		 743 aa  1090    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  73.82 
 
 		 743 aa  1097    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  72.83 
 
 		 729 aa  1049    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  73.4 
 
 		 732 aa  1096    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  68.66 
 
 		 748 aa  1038    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  71.55 
 
 		 733 aa  1070    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  73.3 
 
 		 744 aa  1091    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  75.24 
 
 		 729 aa  1132    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  75.14 
 
 		 713 aa  1130    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  68.66 
 
 		 757 aa  1037    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  67.22 
 
 		 730 aa  1019    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  41.61 
 
 		 697 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 726 aa  498  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1344  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 		 687 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341297  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  34.46 
 
 		 714 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02805  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 696 aa  333  9e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00354555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 853 aa  251  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 851 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 720 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.03 
 
 		 715 aa  211  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 690 aa  210  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 690 aa  206  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 687 aa  198  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 		 695 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 729 aa  189  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 728 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 783 aa  183  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 641 aa  181  5.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 747 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 764 aa  178  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 720 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 732 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 713 aa  170  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 704 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 755 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 761 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 765 aa  163  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 734 aa  160  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 761 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 763 aa  157  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 753 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 802 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 751 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 732 aa  155  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 724 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  24.35 
 
 		 767 aa  154  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 695 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 803 aa  153  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 773 aa  153  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 759 aa  151  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 702 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 710 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 670 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 771 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 794 aa  148  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 712 aa  148  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 718 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 758 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 710 aa  147  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 769 aa  146  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 773 aa  146  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 766 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 743 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1801  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 694 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 700 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 749 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 761 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 737 aa  144  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 733 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 666 aa  143  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 703 aa  141  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  24.47 
 
 		 692 aa  141  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 758 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 730 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 758 aa  140  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 753 aa  140  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  23.15 
 
 		 771 aa  140  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 763 aa  140  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 686 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 774 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 763 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 758 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 713 aa  139  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.25 
 
 		 755 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 		 799 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 758 aa  138  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 731 aa  137  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 750 aa  137  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1803  ferric vibriobactin receptor  24.96 
 
 		 687 aa  137  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 745 aa  137  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 722 aa  137  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 		 759 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 764 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 835 aa  136  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3527  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 694 aa  136  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>