More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2301 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 730 aa  1481    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  37.35 
 
 		 758 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  38.03 
 
 		 739 aa  438  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  37.14 
 
 		 758 aa  427  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  38.54 
 
 		 704 aa  426  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  36.12 
 
 		 769 aa  423  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  35.68 
 
 		 710 aa  418  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 741 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  33.42 
 
 		 761 aa  355  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  33.24 
 
 		 736 aa  355  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 749 aa  329  9e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 		 783 aa  326  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 765 aa  322  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 734 aa  320  7.999999999999999e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 775 aa  312  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 730 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 722 aa  304  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 785 aa  304  4.0000000000000003e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 780 aa  304  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 766 aa  303  7.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 		 743 aa  303  8.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 803 aa  301  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 722 aa  300  8e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  32.05 
 
 		 759 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 755 aa  298  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 726 aa  297  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 743 aa  296  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 737 aa  295  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 790 aa  293  5e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 763 aa  293  8e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 771 aa  291  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 743 aa  290  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 780 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 757 aa  286  9e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 786 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 723 aa  286  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 761 aa  284  5.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 732 aa  284  5.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 822 aa  283  7.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 726 aa  283  9e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 758 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 758 aa  281  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 758 aa  281  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 717 aa  280  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 730 aa  280  6e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 728 aa  279  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 744 aa  278  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 796 aa  276  9e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 735 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 720 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  32.92 
 
 		 731 aa  274  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 758 aa  273  9e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  30.4 
 
 		 759 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 764 aa  271  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 747 aa  270  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 782 aa  270  8.999999999999999e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 817 aa  270  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 745 aa  269  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 790 aa  268  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 728 aa  267  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 789 aa  267  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 796 aa  266  7e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 750 aa  266  8.999999999999999e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 792 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 794 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 774 aa  265  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 759 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  30.54 
 
 		 733 aa  264  4.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 779 aa  264  4.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  32.09 
 
 		 700 aa  263  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 764 aa  262  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 733 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 729 aa  261  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 758 aa  261  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 755 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 713 aa  261  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 771 aa  260  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  29.59 
 
 		 715 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 751 aa  259  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 903 aa  259  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 784 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 759 aa  257  6e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 755 aa  256  7e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 807 aa  256  8e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 792 aa  255  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 776 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 769 aa  254  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 756 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 733 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 764 aa  253  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 777 aa  253  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 783 aa  251  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 771 aa  251  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 730 aa  251  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 753 aa  250  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 733 aa  249  9e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 746 aa  249  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 794 aa  248  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  30.86 
 
 		 695 aa  247  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3419  TonB-dependent receptor  36.68 
 
 		 358 aa  246  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>