More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2041 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  60.93 
 
 		 794 aa  946    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 784 aa  1590    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  41.92 
 
 		 787 aa  588  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 730 aa  325  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 804 aa  324  5e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  34.28 
 
 		 792 aa  310  9e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 784 aa  306  9.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 761 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 775 aa  305  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 704 aa  304  5.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 780 aa  301  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 790 aa  295  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  30.7 
 
 		 763 aa  294  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 858 aa  292  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 860 aa  291  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 803 aa  288  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.41 
 
 		 739 aa  286  7e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 779 aa  286  8e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 790 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 859 aa  283  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 867 aa  281  4e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 764 aa  280  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 720 aa  277  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 755 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 743 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 765 aa  273  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 780 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  29.31 
 
 		 797 aa  271  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  28.87 
 
 		 759 aa  271  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 763 aa  268  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  29.69 
 
 		 807 aa  265  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 817 aa  266  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 730 aa  263  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 851 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 710 aa  260  8e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 771 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 732 aa  257  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 761 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 853 aa  256  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 726 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 769 aa  255  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 736 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 832 aa  253  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 785 aa  252  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 730 aa  250  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 807 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2110  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 765 aa  249  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0914186  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 755 aa  246  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 759 aa  246  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 856 aa  246  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 734 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 764 aa  246  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 741 aa  245  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 728 aa  243  9e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 728 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 771 aa  240  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 747 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 745 aa  240  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 758 aa  239  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  29.57 
 
 		 695 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 746 aa  239  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 758 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 758 aa  238  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 771 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 783 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 722 aa  237  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 771 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 758 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 776 aa  233  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 774 aa  232  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 796 aa  232  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 795 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 808 aa  230  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 733 aa  230  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 766 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 729 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 751 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 758 aa  229  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 733 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 780 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 		 799 aa  227  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 750 aa  226  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 743 aa  226  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 759 aa  226  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2950  TonB-dependent receptor, plug  28.06 
 
 		 850 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101832  normal  0.0641531 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 809 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 757 aa  222  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 814 aa  223  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 724 aa  222  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 775 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 796 aa  220  7e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 806 aa  220  7e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 732 aa  220  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 792 aa  219  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 771 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 803 aa  218  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 726 aa  218  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  29.05 
 
 		 741 aa  218  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 773 aa  217  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 773 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>