More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0377 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 783 aa  1590    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 710 aa  335  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 704 aa  331  3e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 730 aa  325  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 790 aa  318  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 749 aa  319  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 720 aa  318  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 766 aa  310  9e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 765 aa  307  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.85 
 
 		 739 aa  306  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 776 aa  306  7e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 741 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 761 aa  304  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 736 aa  304  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 761 aa  301  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 780 aa  295  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 755 aa  294  5e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 780 aa  294  5e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 763 aa  285  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 758 aa  282  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 792 aa  281  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 775 aa  281  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 764 aa  279  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 790 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 794 aa  276  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 732 aa  271  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 744 aa  271  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 729 aa  270  8.999999999999999e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 745 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 747 aa  268  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 743 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 730 aa  265  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 807 aa  265  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 738 aa  262  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 737 aa  262  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 780 aa  261  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 762 aa  260  8e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 753 aa  259  9e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 774 aa  259  9e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 773 aa  258  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 734 aa  257  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 808 aa  257  6e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 774 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 792 aa  256  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 695 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 764 aa  256  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 759 aa  254  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 730 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 775 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 743 aa  252  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 851 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 771 aa  252  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 786 aa  251  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 773 aa  250  9e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 777 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 832 aa  248  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 937 aa  247  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 758 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 758 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 771 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 761 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 856 aa  246  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  27.35 
 
 		 754 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 758 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  27.64 
 
 		 809 aa  245  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 789 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 769 aa  244  6e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  29.16 
 
 		 747 aa  243  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 758 aa  243  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 779 aa  242  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 728 aa  241  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 758 aa  241  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 759 aa  241  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 794 aa  241  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 787 aa  240  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 784 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 726 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 797 aa  238  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 796 aa  238  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 731 aa  237  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 725 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 767 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 817 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 804 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 771 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 743 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 785 aa  234  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 771 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 722 aa  234  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 758 aa  234  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 748 aa  232  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 771 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2405  TonB-dependent receptor, plug  27.87 
 
 		 786 aa  232  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0816065  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 750 aa  231  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 808 aa  231  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 755 aa  230  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 779 aa  230  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 730 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  27.45 
 
 		 807 aa  229  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 797 aa  229  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>