More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6222 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 797 aa  1599    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  44.27 
 
 		 797 aa  567  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  41.93 
 
 		 783 aa  540  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  39.31 
 
 		 798 aa  522  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  39.78 
 
 		 755 aa  489  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  39.62 
 
 		 741 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  38.27 
 
 		 761 aa  429  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2919  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 763 aa  352  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.239028  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 		 757 aa  334  4e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 790 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 790 aa  249  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 803 aa  249  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  32.12 
 
 		 767 aa  245  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 769 aa  242  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 704 aa  238  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 778 aa  234  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 778 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 720 aa  231  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 730 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 783 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 764 aa  224  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 751 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 800 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 800 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 786 aa  220  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 755 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 808 aa  211  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 787 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 838 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 777 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 763 aa  208  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.14 
 
 		 739 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 780 aa  208  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 749 aa  206  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 780 aa  207  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0787  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 788 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.114604  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  38.27 
 
 		 906 aa  206  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 788 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 790 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 790 aa  204  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 896 aa  203  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 814 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 747 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 771 aa  201  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 724 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 783 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 732 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 792 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  28.32 
 
 		 754 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 903 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 835 aa  196  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.97 
 
 		 715 aa  196  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 775 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 766 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 780 aa  195  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 860 aa  195  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 864 aa  193  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 919 aa  193  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 765 aa  193  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 734 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 815 aa  192  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 755 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  28.36 
 
 		 784 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 753 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 731 aa  190  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 862 aa  190  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 726 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 803 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 759 aa  188  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 726 aa  187  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 794 aa  185  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  26.68 
 
 		 839 aa  184  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 796 aa  184  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 794 aa  184  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 741 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0549  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 832 aa  184  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 765 aa  184  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 743 aa  184  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 851 aa  184  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 728 aa  183  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 737 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 775 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 810 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 761 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 790 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 769 aa  181  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 775 aa  181  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 771 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 762 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 779 aa  180  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  25.85 
 
 		 748 aa  180  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 722 aa  180  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 730 aa  180  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 783 aa  179  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 		 695 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 784 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 730 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 713 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 815 aa  178  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 780 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>