More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3044 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 775 aa  1584    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  42.32 
 
 		 779 aa  555  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  35.7 
 
 		 780 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  32.51 
 
 		 776 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  34.73 
 
 		 769 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 776 aa  360  7e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 783 aa  288  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 803 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 840 aa  271  5e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2469  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 843 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 777 aa  247  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 741 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 730 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 720 aa  237  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 749 aa  235  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 790 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 790 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 824 aa  233  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 747 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0667  putative TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 793 aa  225  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 704 aa  225  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 808 aa  224  6e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 732 aa  224  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 734 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 792 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 784 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 713 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 771 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.37 
 
 		 739 aa  214  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 745 aa  213  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 736 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 797 aa  212  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.81 
 
 		 755 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 722 aa  210  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 780 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 724 aa  208  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 756 aa  207  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 761 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 743 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 758 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 764 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 726 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 763 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 741 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 790 aa  201  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 730 aa  200  7.999999999999999e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 730 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 814 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 835 aa  197  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 789 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 783 aa  196  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 775 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 771 aa  194  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 790 aa  194  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 755 aa  193  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 690 aa  192  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 751 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 761 aa  191  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 780 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 710 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 864 aa  190  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 722 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 797 aa  189  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 732 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 838 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 690 aa  188  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 765 aa  188  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 753 aa  187  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 783 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 767 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 725 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 717 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 796 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 803 aa  185  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 764 aa  184  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 769 aa  184  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 788 aa  184  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 779 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 744 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 735 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 743 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 729 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 764 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 767 aa  181  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 803 aa  181  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 757 aa  181  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 762 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 903 aa  180  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 771 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 723 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 771 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 728 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 755 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 765 aa  179  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 755 aa  177  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 780 aa  177  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 779 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 786 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 855 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 773 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>