More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1115 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 839 aa  1696    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  41.12 
 
 		 864 aa  576  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  41.09 
 
 		 838 aa  555  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 		 919 aa  457  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 862 aa  352  1e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 815 aa  323  6e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 862 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  29.47 
 
 		 906 aa  308  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 880 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 896 aa  294  5e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 903 aa  282  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 769 aa  252  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 780 aa  249  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 796 aa  247  8e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 860 aa  245  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 777 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 803 aa  228  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 783 aa  220  7.999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 761 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 767 aa  214  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 808 aa  213  9e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 780 aa  212  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 764 aa  202  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 783 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 803 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 778 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 822 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  25.83 
 
 		 809 aa  196  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 777 aa  194  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 810 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 873 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 771 aa  191  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 726 aa  188  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 832 aa  187  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 797 aa  184  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 798 aa  182  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 803 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 762 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 783 aa  181  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 763 aa  181  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 790 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  26.94 
 
 		 776 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 800 aa  179  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 800 aa  179  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 780 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 771 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 		 776 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 774 aa  174  7.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 790 aa  173  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 779 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 776 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 780 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 730 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0865  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 829 aa  168  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0714067  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 765 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 722 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  24.32 
 
 		 715 aa  165  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 723 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 703 aa  164  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 815 aa  163  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 735 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 809 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 808 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 759 aa  159  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 774 aa  158  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 775 aa  157  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 796 aa  157  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_003910  CPS_0667  putative TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 793 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 755 aa  156  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 764 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 773 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 794 aa  152  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  25.23 
 
 		 748 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 809 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 764 aa  152  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 775 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 789 aa  151  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  24.07 
 
 		 755 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 741 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 778 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 770 aa  147  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 814 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  29.65 
 
 		 755 aa  146  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 722 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 786 aa  145  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 773 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0549  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 832 aa  145  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 729 aa  144  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 785 aa  143  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1110  Outer membrane receptor protein mostly Fe transport-like protein  24.38 
 
 		 862 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 790 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 795 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  26.18 
 
 		 784 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 756 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 794 aa  142  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 835 aa  141  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 710 aa  140  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 747 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 784 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 		 792 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>