More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1539 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 735 aa  1501    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 		 808 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 794 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  34.61 
 
 		 789 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 796 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 812 aa  338  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 759 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 744 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 730 aa  269  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 704 aa  266  7e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 766 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 722 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  30.27 
 
 		 747 aa  252  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 723 aa  245  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 720 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 732 aa  241  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 717 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 733 aa  238  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.01 
 
 		 739 aa  237  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 738 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 763 aa  232  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 729 aa  233  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 771 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 775 aa  231  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 758 aa  229  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 737 aa  226  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 790 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 747 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 769 aa  222  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 710 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 777 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 790 aa  220  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 722 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 758 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 730 aa  218  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 761 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 756 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 755 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 726 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 792 aa  214  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 765 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 809 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 730 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 780 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 724 aa  211  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 736 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 785 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 773 aa  207  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 764 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 759 aa  206  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 726 aa  204  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0865  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 829 aa  204  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0714067  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 741 aa  203  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 755 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 730 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  28.48 
 
 		 776 aa  200  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 725 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 779 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 769 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 749 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 803 aa  196  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  27.72 
 
 		 755 aa  195  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  25.33 
 
 		 797 aa  195  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 796 aa  195  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 728 aa  194  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 771 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 726 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 807 aa  193  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 782 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 789 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 734 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 764 aa  192  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 807 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 695 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 817 aa  191  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 746 aa  190  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.4 
 
 		 755 aa  190  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 780 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  25.99 
 
 		 754 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 767 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 758 aa  189  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 784 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 764 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 728 aa  187  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 779 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 755 aa  187  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 783 aa  185  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 779 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 757 aa  184  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 822 aa  184  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 743 aa  184  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 786 aa  182  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 767 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  25.29 
 
 		 789 aa  182  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 741 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 761 aa  181  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  26.23 
 
 		 741 aa  180  8e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 748 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 809 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 776 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>