More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4348 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 755 aa  1544    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  39.35 
 
 		 758 aa  481  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  37.99 
 
 		 756 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 771 aa  330  8e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 763 aa  306  9.000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 743 aa  298  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 822 aa  290  5.0000000000000004e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 730 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 764 aa  280  9e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 773 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 777 aa  268  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 784 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 767 aa  260  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  30.51 
 
 		 733 aa  259  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 773 aa  258  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 730 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 765 aa  254  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 737 aa  252  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 743 aa  251  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 785 aa  247  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 764 aa  246  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 722 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 748 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 704 aa  238  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 759 aa  236  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 764 aa  234  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 761 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 734 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 789 aa  232  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 774 aa  231  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 810 aa  231  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 780 aa  231  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 743 aa  230  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 792 aa  230  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 720 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 779 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 783 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 726 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 790 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 771 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 803 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3344  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 791 aa  227  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 767 aa  228  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 795 aa  226  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 807 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 766 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 755 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 782 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 780 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 809 aa  224  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 723 aa  223  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 710 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 764 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 794 aa  221  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 790 aa  220  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 749 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 729 aa  219  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 725 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 732 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 779 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 757 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  26.69 
 
 		 789 aa  216  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 735 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 753 aa  214  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.31 
 
 		 739 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 769 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  28.94 
 
 		 776 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 746 aa  214  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 857 aa  213  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1443  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 863 aa  212  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 730 aa  210  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 808 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 747 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 771 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 771 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 785 aa  205  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 773 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 773 aa  204  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 717 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 794 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 817 aa  202  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 758 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 753 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 796 aa  201  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 784 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 864 aa  200  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 838 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 775 aa  198  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 780 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 761 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 786 aa  196  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 758 aa  195  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 726 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 769 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 745 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 763 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 728 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 758 aa  192  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 751 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 856 aa  190  9e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>