More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0838 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 784 aa  1602    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  41.39 
 
 		 767 aa  536  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  39.82 
 
 		 779 aa  511  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  40.33 
 
 		 764 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  39.12 
 
 		 785 aa  503  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  37.91 
 
 		 809 aa  490  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  36.48 
 
 		 773 aa  474  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  36.13 
 
 		 795 aa  475  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  38.27 
 
 		 790 aa  472  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 822 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 810 aa  346  7e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 777 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 755 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 771 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 720 aa  251  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1443  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 863 aa  230  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161464 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 743 aa  226  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 756 aa  224  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 704 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 763 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 746 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 758 aa  221  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 785 aa  220  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 741 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 730 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 728 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 775 aa  210  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 734 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 732 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 761 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 763 aa  203  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 730 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 725 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 792 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 779 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 769 aa  197  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 737 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 789 aa  194  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 790 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  26.67 
 
 		 784 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 780 aa  190  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 724 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 717 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 787 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 710 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  25.91 
 
 		 822 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 773 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 722 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 748 aa  184  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 780 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 759 aa  182  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 765 aa  182  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 794 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 864 aa  182  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 803 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 743 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 726 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 757 aa  178  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 857 aa  178  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  26.88 
 
 		 733 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 764 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 775 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 790 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  25.38 
 
 		 829 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 730 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 720 aa  174  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 723 aa  174  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  24.94 
 
 		 809 aa  174  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 754 aa  173  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 838 aa  173  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 797 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 731 aa  171  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 757 aa  171  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 771 aa  170  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 743 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 729 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  24.71 
 
 		 754 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 755 aa  167  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 769 aa  167  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  26.87 
 
 		 759 aa  167  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 783 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  25.32 
 
 		 797 aa  165  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 736 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 779 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 856 aa  164  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 764 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 808 aa  164  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 695 aa  164  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 761 aa  163  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  24.5 
 
 		 747 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 713 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 790 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 700 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  24.48 
 
 		 767 aa  162  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 784 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 780 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 758 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 753 aa  161  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 758 aa  160  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 790 aa  160  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>