More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1010 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 769 aa  1568    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  35.31 
 
 		 783 aa  444  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 803 aa  399  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 775 aa  357  5.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 776 aa  342  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  30.9 
 
 		 776 aa  342  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 780 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 779 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 777 aa  295  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 840 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 713 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0667  putative TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 793 aa  281  5e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  29.33 
 
 		 755 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2469  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 843 aa  273  9e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 741 aa  269  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 824 aa  268  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1889  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 817 aa  268  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 763 aa  258  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 784 aa  258  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 730 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  27.56 
 
 		 839 aa  254  5.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 726 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 717 aa  250  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 919 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 797 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 722 aa  243  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 785 aa  241  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 765 aa  241  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 720 aa  240  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 732 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 761 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 786 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 814 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 756 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 838 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 757 aa  234  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 864 aa  234  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 		 695 aa  233  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 790 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 808 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 786 aa  231  6e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 792 aa  230  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 729 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 769 aa  229  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 758 aa  229  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 722 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 797 aa  226  9e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 803 aa  226  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 747 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 704 aa  224  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 710 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 764 aa  224  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 798 aa  224  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 771 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 903 aa  222  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 767 aa  222  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 733 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 848 aa  223  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 790 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 790 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 765 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 783 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 854 aa  221  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 780 aa  222  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 745 aa  221  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.37 
 
 		 715 aa  221  6e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 780 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.98 
 
 		 739 aa  220  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 741 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 783 aa  219  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 790 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 778 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 778 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 794 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 755 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 761 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 851 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 855 aa  215  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 730 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 804 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 761 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 780 aa  212  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 766 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 749 aa  211  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 803 aa  210  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 751 aa  210  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 873 aa  210  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 734 aa  208  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 794 aa  207  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 779 aa  207  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 787 aa  207  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 755 aa  207  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 780 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 743 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 771 aa  204  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 730 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 728 aa  203  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  28.01 
 
 		 759 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 753 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 755 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>