More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2471 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 732 aa  1490    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  53.64 
 
 		 720 aa  730    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 764 aa  326  9e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 704 aa  324  3e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 763 aa  309  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 761 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 734 aa  297  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 751 aa  294  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 749 aa  292  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 724 aa  289  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 759 aa  288  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 710 aa  287  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 803 aa  287  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 790 aa  286  7e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 730 aa  286  9e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 729 aa  281  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 790 aa  280  7e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 732 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 723 aa  276  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 783 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 726 aa  275  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 792 aa  274  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 786 aa  273  6e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 730 aa  270  8e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 771 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 784 aa  267  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 755 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 766 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 787 aa  265  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 771 aa  265  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 733 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 745 aa  262  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 788 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 807 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 726 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 780 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 794 aa  260  5.0000000000000005e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 775 aa  260  7e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 769 aa  259  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 782 aa  258  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 785 aa  257  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 743 aa  256  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 764 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 780 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 761 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 728 aa  255  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  30.79 
 
 		 755 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 		 767 aa  254  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 722 aa  253  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 765 aa  254  6e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 808 aa  251  4e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 722 aa  251  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 773 aa  250  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 778 aa  250  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 855 aa  250  8e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 771 aa  250  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 873 aa  249  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 736 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 767 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 778 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 725 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 773 aa  247  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 790 aa  246  9e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 851 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 762 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 785 aa  245  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 769 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 773 aa  244  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 735 aa  244  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.14 
 
 		 739 aa  243  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 786 aa  241  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 838 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 741 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 790 aa  239  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 741 aa  238  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 756 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 728 aa  238  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 803 aa  238  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 777 aa  237  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 743 aa  237  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 864 aa  237  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 783 aa  236  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 713 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 794 aa  235  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 747 aa  235  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  28.06 
 
 		 759 aa  233  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 796 aa  232  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 809 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 771 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 758 aa  230  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 790 aa  230  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 730 aa  229  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 713 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 771 aa  228  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 804 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 764 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 731 aa  227  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 780 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 779 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 779 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>