More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1136 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 765 aa  1545    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  36.93 
 
 		 803 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  37.57 
 
 		 755 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  37.34 
 
 		 780 aa  465  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  36.89 
 
 		 761 aa  451  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  34.8 
 
 		 761 aa  439  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  35.08 
 
 		 776 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 792 aa  416  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  36.25 
 
 		 790 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  35.43 
 
 		 807 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 859 aa  379  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 790 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  33.42 
 
 		 780 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 851 aa  364  4e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 867 aa  360  7e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 704 aa  357  5e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  34.86 
 
 		 753 aa  340  5.9999999999999996e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 745 aa  326  9e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 730 aa  325  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 723 aa  311  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 728 aa  310  6.999999999999999e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 856 aa  308  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 783 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 743 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 741 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 720 aa  303  7.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 710 aa  301  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  39.07 
 
 		 832 aa  296  7e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 764 aa  294  5e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 750 aa  293  6e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 749 aa  292  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 817 aa  291  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 775 aa  291  4e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 796 aa  290  6e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 747 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 728 aa  284  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 759 aa  281  3e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 784 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 787 aa  278  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 755 aa  277  5e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 758 aa  277  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 758 aa  276  9e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 758 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 758 aa  273  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 771 aa  273  7e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 771 aa  273  9e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  30.4 
 
 		 754 aa  272  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 773 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 773 aa  270  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 774 aa  270  8e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.36 
 
 		 739 aa  269  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 771 aa  267  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 730 aa  267  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 786 aa  266  8e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 804 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  27.81 
 
 		 751 aa  265  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 734 aa  264  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 763 aa  263  6e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 736 aa  262  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 743 aa  263  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 729 aa  262  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 732 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 774 aa  261  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 785 aa  258  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 759 aa  258  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  31.52 
 
 		 733 aa  256  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 755 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 775 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 717 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 773 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 730 aa  254  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 764 aa  253  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 777 aa  254  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  28.75 
 
 		 755 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 762 aa  250  7e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 779 aa  250  9e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 730 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 794 aa  248  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 777 aa  248  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 753 aa  248  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 771 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 782 aa  247  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 733 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 780 aa  244  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 764 aa  244  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 784 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 779 aa  242  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 770 aa  241  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 751 aa  241  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 758 aa  241  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 766 aa  241  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 731 aa  240  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 722 aa  240  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 713 aa  240  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 724 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 808 aa  238  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 792 aa  238  5.0000000000000005e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 743 aa  236  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 726 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  28.36 
 
 		 759 aa  235  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>