More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4618 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 733 aa  1489    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  62.97 
 
 		 730 aa  914    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  64.74 
 
 		 743 aa  942    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  36.34 
 
 		 774 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  37.46 
 
 		 779 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 		 789 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  33.99 
 
 		 782 aa  351  3e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  31.76 
 
 		 789 aa  334  3e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 764 aa  320  6e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  34.58 
 
 		 767 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 773 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 772 aa  293  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 737 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 755 aa  259  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 761 aa  253  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 730 aa  253  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 765 aa  253  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30 
 
 		 739 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 756 aa  250  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 755 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 720 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 758 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 771 aa  243  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 763 aa  241  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 743 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 748 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 759 aa  238  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 749 aa  236  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 704 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 729 aa  231  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 764 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 741 aa  230  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 794 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 746 aa  228  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 710 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 766 aa  224  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 777 aa  223  9e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 732 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 792 aa  220  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 790 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 780 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 733 aa  213  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 807 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 761 aa  206  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 758 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 771 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 723 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 773 aa  205  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 783 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 773 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 790 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 769 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 780 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 795 aa  200  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 796 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 822 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 817 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 803 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 713 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 725 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 702 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 796 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 747 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 785 aa  191  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 726 aa  190  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 758 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 794 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 775 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 790 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 722 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  26.32 
 
 		 797 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 777 aa  184  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 751 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  25.69 
 
 		 809 aa  184  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 734 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 773 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 700 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 736 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 767 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 731 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 761 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 771 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 744 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 722 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 808 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 784 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 786 aa  177  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 743 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 785 aa  175  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 728 aa  174  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 724 aa  174  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 804 aa  174  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 757 aa  172  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 726 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 730 aa  170  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 764 aa  170  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  26.53 
 
 		 829 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 753 aa  168  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 794 aa  168  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 764 aa  167  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>