More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00767 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 772 aa  1570    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  37.56 
 
 		 782 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  34.17 
 
 		 764 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 		 730 aa  358  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 774 aa  355  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 743 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 789 aa  310  6.999999999999999e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  30.57 
 
 		 789 aa  293  6e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  30.17 
 
 		 733 aa  293  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 779 aa  289  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 767 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 773 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 771 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 704 aa  238  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 761 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 758 aa  224  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 747 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 803 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 765 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 783 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 766 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 756 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 790 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 763 aa  211  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 764 aa  210  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 759 aa  208  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 755 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 777 aa  205  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 741 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  27.79 
 
 		 797 aa  201  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 794 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 720 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 732 aa  196  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 731 aa  195  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 780 aa  193  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 729 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 822 aa  191  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 761 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 860 aa  190  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  25.96 
 
 		 695 aa  190  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 726 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  25.63 
 
 		 759 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 787 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 722 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 785 aa  187  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 710 aa  187  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 779 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 775 aa  185  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 744 aa  184  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 796 aa  183  9.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 785 aa  183  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  27.62 
 
 		 747 aa  181  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 730 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.46 
 
 		 739 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 733 aa  179  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 856 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 790 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 792 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 743 aa  179  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 809 aa  177  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 867 aa  175  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 783 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  25.84 
 
 		 829 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 862 aa  174  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 700 aa  174  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 764 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 751 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 764 aa  171  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 771 aa  170  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 730 aa  170  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 758 aa  170  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 713 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1679  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 742 aa  166  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0383405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 758 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 755 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 773 aa  166  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 722 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 767 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 741 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 792 aa  163  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 775 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 758 aa  161  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 808 aa  161  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 784 aa  160  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3344  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 791 aa  160  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.91 
 
 		 755 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 807 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 780 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 776 aa  159  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 758 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 851 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 803 aa  158  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 733 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  24.94 
 
 		 767 aa  156  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 796 aa  155  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 769 aa  154  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  24.12 
 
 		 809 aa  154  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 788 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 780 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 761 aa  151  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>