More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0037 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  47.81 
 
 
769 aa  698    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  100 
 
 
757 aa  1532    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  52.36 
 
 
738 aa  708    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  47.35 
 
 
754 aa  625  1e-178  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  45.07 
 
 
758 aa  623  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  47.19 
 
 
731 aa  619  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  43.77 
 
 
777 aa  596  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1679  TonB-dependent receptor  46.09 
 
 
742 aa  598  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0383405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  41.59 
 
 
776 aa  528  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  40.47 
 
 
761 aa  496  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  40.3 
 
 
763 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 
773 aa  258  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 
763 aa  257  7e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 
747 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 
771 aa  255  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 
773 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 
771 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 
737 aa  233  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 
743 aa  227  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 
704 aa  224  6e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 
794 aa  218  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 
730 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 
773 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 
782 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 
759 aa  206  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 
758 aa  204  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 
743 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 
723 aa  198  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 
725 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 
762 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 
710 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 
790 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 
720 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 
792 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 
778 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.86 
 
 
755 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 
748 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 
778 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 
756 aa  187  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 
730 aa  187  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 
761 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 
726 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 
774 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  27.51 
 
 
754 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 
764 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 
713 aa  183  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 
769 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 
798 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 
729 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 
743 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 
741 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  27.85 
 
 
763 aa  181  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 
766 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 
765 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 
764 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 
780 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 
786 aa  177  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 
734 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 
746 aa  177  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 
755 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 
783 aa  174  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 
732 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 
779 aa  175  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 
783 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 
767 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 
758 aa  174  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 
785 aa  173  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27 
 
 
732 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 
761 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 
735 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 
780 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  27.52 
 
 
733 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 
761 aa  171  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 
784 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 
803 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 
780 aa  169  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 
738 aa  168  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 
731 aa  167  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 
764 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 
728 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  25.9 
 
 
759 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 
759 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 
803 aa  166  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 
774 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 
758 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 
755 aa  165  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 
730 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 
767 aa  164  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 
745 aa  164  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 
790 aa  163  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  24.35 
 
 
797 aa  163  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  26.43 
 
 
741 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 
755 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 
853 aa  162  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.83 
 
 
739 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 
779 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 
755 aa  161  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 
757 aa  161  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2110  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 
765 aa  161  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0914186  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 
857 aa  160  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>